巴旦木和杏仁在種類，形狀，大小上都有區別：

1、根據種類區分。巴旦木是桃屬中扁桃亞屬的植物；而杏仁屬於薔薇科植物。

2、根據形狀區分。杏仁果為扁平卵形，一端圓，另一端尖；巴旦木的果實呈扁而長，好似橢圓的形狀。

3、根據個頭大小區分。杏仁果實比巴旦木果實小很多。

1、巴旦木有名巴旦杏，也俗稱薄殼杏仁，是新疆維吾爾族最珍視的乾果，木按植物分類學，巴旦杏不是杏而是桃屬中扁桃亞屬的植物，扁圓，果肉乾澀無汁不能食，主要吃巴旦木的仁。仁味超過核桃和杏仁，有特殊的甜香風味。

巴旦木營養價值比同重量的牛肉高6倍，餅含有少量胡蘿蔔素，維生素B1，B2和消化酶、杏仁素酶、杏仁成、鈣、鎂、鈉、鉀，同事含有鐵鈷等18種微量元素。巴旦木仁是維吾爾族人傳統的健身滋補品，有人每日睡覺前細嚼十餘粒，開水衝下，長期食用，夜間能通宵睡熟無夢，身體抵抗力顯著增強，報紙身強體壯。

巴旦木可以安神，開竅，健腦，明目益腎，潤肺，潤腸，生精，健身，健胃等。主治心悸喘咳，腎氣不足，腰膝痠軟，陽痿尿頻等病症。除與漢族用藥的相同之處外，維藥甜巴旦木更具其獨特的功效。

對於孕婦，巴旦木不但可以滋補身體還有健腦作用，對胎兒發育很有好處。

2、杏仁不同於巴旦木，杏仁有名杏核，分為甜杏仁及苦杏仁兩種。中國南方產的杏仁屬於甜杏仁（又名南杏仁），味道微甜、細膩，多用於使用，還可作為原料加入蛋糕，曲奇和菜餚中；北方產的杏仁則屬於苦杏仁（又名北杏仁），帶苦味，多作藥用，具有潤肺、平喘的功效。

杏仁的營養價值很高，而杏仁的營養價值更豐富。杏仁含有豐富的但不飽和脂肪酸，有益於心臟健康；含有維生素E等抗氧化物質，能預防疾病和早衰。

雖然杏仁有許多的藥用，食用價值，但不可以大量使用。杏仁含有毒物質氫氰酸，過量服用可致中毒。所以，使用前必須現在水中浸泡多次，餅加熱煮沸，減少以至消除其中的有毒物質。

對於孕婦忌食杏和杏仁，行有熱性及其滑胎的特性，是孕婦的大忌。