乙肝病毒的基因組（HBV-DNA）是由兩條螺旋的DNA 鏈圍成的一個環形結構。其中一條較長負鏈已經形成完整的環狀；另一條長度較短的正鏈，呈半環狀。在感染肝細胞之後，這條半環狀的DNA鏈就會以負鏈為模板，在催化劑──HBV-DNA聚合酶的作用下延長，最終形成完整的環狀。這時的乙肝病毒基因組就形成了一個完全環狀的雙股DNA。把這種DNA稱做共價閉合環狀DNA（即cccDNA），可以把它看作是病毒複製的原始模板。模板形成後，病毒基因會以其中的一條cccDNA為模板，利用肝細胞基因中的酶和DNA 聚合酶的“催化”，一段基因又一段基因地複製，形成負鏈和正鏈。最後再裝配到一起形成新的HBV-DNA顆粒。

複製的第一步：黏附

HBV人侵人體後，依靠其外膜(表面抗原，HBsAg)能粘附在肝細胞膜上。一旦粘附成功，HBV甩掉了外膜，鑽進肝細胞內。

複製的第二步；脫殼

HBV核心部分來到肝細胞內，在肝細胞漿中還要脫掉它的“核殼”(核心抗原即HBcAg及e抗原即HbeAg)，暴露出了它最核心部分，即乙肝病毒核酸(HBv DNA)。

複製的第三步：入核

HBV DNA從肝細胞漿內進入肝細胞核，在這裡它要進一步發育完善，形成了HBv的“共價閉合環狀脫氧核塘核酸”(HBv cccDNA)。cccDNA深深藏匿在肝細胞核內，而肝細胞核外面有一層堅韌的核膜。目前藥物都難以透過這堅韌的核膜，因而對cccDNA也無可奈何，但cccDNA卻掌控著HBV所有的遺傳資訊，指令著HBv的複製。因此現有的藥物想徹底消滅人體內的HBv真比登天還難，這些藥物只能抑制HBv的繁殖或複製，“全部轉陰”也只能是一種幻想。

複製的第四步：轉錄

HBV在這一階段會以cccDNA為“模板”，把HBv cccDNA上的所有資訊全都轉錄到“資訊核糖核酸”(mRNA)上。這個轉錄過程需要人體內的酶類幫忙，因為所有的病毒都不能自己獨立生活．必須有生物的機體幫忙，才能完成這個轉錄過程。HBv也是這樣。在人體酶類的幫助下完成它的複製環節。

複製的第五步：翻譯

在mRNA上已錄取了HBv的所有資訊，然後就是“翻譯”了，其實就是開始製造病毒蛋白。MRNA透過“翻譯”過程，可將HBv的各種蛋白製造出來，如HBv的外膜蛋白(HBsAg)、核殼蛋白(HBeAg、HBcAg)、HBvDNA多聚酶等；至此，HBv的外膜有了，HBv的核殼也有了，這些東西只是零件，飄浮游離著的，還有重要的HBv最核心部分沒有“製造”山來。

複製的第六步：逆轉錄

HBv的mRNA上的遺傳資訊最後就轉錄成了HBV的DNA，這時，HBv的最核心部分(即HBv DNA)也算製造完成。

複製的第七步：組裝

把第五步和第六步零件進行組裝，裝配妥了，HBV的複製也算大功告成了。