防治方法有一下幾種：1.注意水質變化。若池水過肥，應及時加註新水，或更換池水改善水質。平時定期加水或者採用微流水養殖。2.定期消毒池水。每畝水面用生石灰10公斤進行全池遍灑，或遍灑1ppm的漂白粉。應施用腐熟有機肥，以防止水質老化，控制絲狀綠藻繁殖。3.洗刷與藥浴結合。用廢舊聚乙烯網片擦洗效果較好，春秋二季每兩個月洗刷一次，冬季洗一次。在5月～9月綠藻繁殖高峰季節，每月洗一次，以保持乾淨。刷後用8ppm硫酸銅溶液浸泡15分鐘～20分鐘，以殺滅殘留藻種。4、用0.7PPM硫酸銅溶液殺滅。5.渾泥漿水防除。用黃泥土加適量豬糞(豬糞是黃泥土的30%左右)，兌成稀泥漿潑灑水面，每天一次，連潑3次～4次即可，省工省時效果好。6.搭配放養有舔刮附生性生物食性的魚類。

1物理清除法：

簡單的說就是拿刷子去刷，市面上賣的磁鐵刷，魚缸刷都很好用，同時換水，效果極佳。缺點是麻煩，角落等地方不易清除，缸子大的話更是大工程。

2化學清除法：

使用除藻劑，效果普通，優點是對任何藻類都有效，且可有效清除附著在水草、沉木等不易清除地方的藻類。缺點是依據品質不同對魚和生態平衡有一定程度的衝擊。

3生物清除法〔最佳方式〕：

使用除藻動物（如：笠螺，.白玉飛狐，琵琶鼠、黃金琵琶鼠，黑殼蝦，大和藻蝦）來控制藻類的數量，效果為三種中所花費時間較長，但最安全也最省力的方式。