原作裡沒有明說，但是M3以後已經算是預設知道。

M3世紀末的魔術師和漫畫卷20的魔術愛好者聚會的事件應該是有所暗示的。

順一下時間線：

基德第一次出現在柯南片場是1997年4月發表的156話，並且讓小蘭看到了和新一長得很像的高中生（也就是快鬥）一週後的416是M1公映。1998年1月29日發表192話，基德第二次出現在柯南本篇中，也就是魔術愛好者事件。同年4月M2上映。眾所周知，柯南劇場版每次結束後都會立即宣佈下一部已經制作決定，可以猜測M3的選材和青山已經展開探討和前期準備。1999年4月，魔術快鬥發表漆黑之星篇，基德與新一本體對決（就是TV動畫黃昏之館前半的故事），之後就是M3上映。也就是說透過作者和官方都向觀眾正式提出了“基德（快鬥）長得和新一極其相似”這歌設定（雖然初登場就有所提及）至於為什麼像73說是有原因的，還沒說。漫畫中1996年10月的131（卷14）-1999年6月（危命的復活篇），小蘭事實上都處於一種懷疑觀察並認定柯南=新一的過程中，只是沒開口。同時這期間的讀者和觀眾也在不斷猜測小蘭的態度，並且在M3中體現了出來。

卷16.基德和柯南初次見面。基德稱呼他是“小朋友”，並且評論了二人的關係。

之後在鈴木遊輪上基德易容了小蘭。根據魔術快斗的設定，快鬥每次行動前會對易容物件進行一番調查，查到小蘭身邊的柯南是很自然的。至於他對這“不普通的小朋友”查到什麼程度這點沒說。

原版的稱呼：初次見面不是喊小子就是偵探君。

20卷的魔術愛好者事件，柯南透過園子完成推理後，依然是“偵探君”。

但是臨走前的稱呼改成了名偵探｛大偵探）

這個事件柯南的操作是把傳聲器貼在園子身後的樹上完成。在場的人都以為是園子解決時間，基德本人還稱呼為“園子大偵探”。

可是和柯南二人單獨對話時卻說，自己本職不是偵探，柯南又重感冒影響查案，所以沒有來得及阻止這起命案。言下之意他知道這個事件實際解決者是柯南。

這能說明：他知道柯南具有超常的推理能力，有模仿他人聲線的技術。被模仿的人會“沉睡”

不確定的：沉睡的小五郎背後是柯南。柯南的真實身份。

之後的一次出場就是卷30的黃昏之館。基德看到柯南有麻醉針手錶毫不驚訝。可以推測他知道柯南使人昏睡的手段是用手錶工具。（他自己就經常把人弄睡著應該業務熟練）

其他還有的

卷55.回憶中快鬥小時候見過有希子。著名女演員有希子嫁給小說家工藤優作生了個兒子叫工藤新一，是高中生偵探，目前銷聲匿跡。這是隻要調查一下很容易得到的資訊。

所以基德在調查小蘭的事情時結合柯南超常的推理能力從而推測柯南和新一的關係也是可以的。

雖然目前漫畫裡完全沒有明確闡述基德是不是知道這件事，又是怎麼知道的。應該是因為這個劇情不方便在本篇中從正面角度用詳細的篇幅表達出來，所以乾脆含糊其辭，反正大多觀眾預設基德已經知道了。如果73以後非要說他還不知道也還有餘地，但是可能性非常低。基德和柯南本篇的關係估計會一直這麼神神秘秘含糊下去。