如果結石的體積小於6毫米，即便是單腎多發性的小結石則可以透過多喝水、多運動（以跳躍運動為主）可以自行排出體外。如果結石大於6毫米甚至到釐米了，則需要透過用藥或體外碎石的治療方法來進行排石，當然也需要多喝水、多運動，才更有利於結石的排出。飲食方面也要注意忌口辛辣刺激、油膩、海鮮、動物內臟、高鈣等食物的攝入，飲食清淡、低鹽、低脂、低鈣、高維生素、葷素搭配、營養均衡即可。

腎結石治療方法有很多，比如體外衝擊波碎石，輸尿管軟鏡，經皮腎鏡手術等，一般較小的單髮結石（小於1.5cm）可以透過體外衝擊波碎石來治療。如果結石多發，體積較小，沒有明顯的積水，輸尿管軟鏡處理會更安全。但是比較大的或多發、複雜的腎結石還是首選經皮腎鏡手術。

經皮腎鏡手術是建立一條從面板到腎臟的通道，應用鈥鐳射或EMS彈道超聲來碎石和取石，在處理一些鬆軟的或感染性結石方面優勢明顯。下面是經皮腎鏡手術術中的影片，可以看到結石被EMS超聲碎石後立即被吸出體外，這樣不僅縮短了手術時間，而且提高了清石效率。目前泌尿外科指南推薦大於2cm或複雜的結石首選經皮腎鏡手術。

下面是近期處理的一例多發的複雜腎結石圖片，CT示雙側多髮結石，左腎結石較多，行左側經皮腎鏡碎石取石術，術中建立3個通道，一次將結石完全取出。