根據記載和現存拓片，玉璽字跡有“受命於天，既壽永昌”、“受命於天，既壽且康”以及“受天之命，皇帝壽昌”三種說法。明朝大量製作帝王用璽以沖淡無傳國玉璽之虛。到了明朝共制二十四方玉璽，稱二十四御寶。皇帝奉天之寶：為傳國璽，以鎮萬國，祀天地。用於祭天等大典禮儀。皇帝之寶：以頒詔與赦。皇帝日常用璽。皇帝行寶：以冊封賜勞。用於賞賜。皇帝信寶：以徵召軍。用於召親王大臣及調兵征伐。天子之寶：以祭享百神。用於祭祀山川鬼神。天子行寶：以封賜夷蠻。用於冊立藩邦，封外國及賜勞。天子信寶：以調發番兵。用於施命外夷，招外服及徵發。制誥之寶：以識誥命。用於頒佈誥書，諭示臣僚。敕命之寶：以識敕命。用於鈐印聖旨。廣運之寶：以識黃選勘籍；以獎勵臣工。皇帝尊親之寶：以上尊號。用於祭祀宗廟。皇帝親親之寶：以諭親王。用於冊立親藩。敬天勤民之寶：以訓迪有司。用於賞賜守令官吏，敕諭朝覲官。御前之寶：以進御座、從軍駕。表章經史之寶：以求經籍。欽文之璽：以欽文教。以上為明太祖所制十六寶，材質以青玉、白玉為主。其中“皇帝奉天之寶”、“皇帝親親之寶”、“敕命之寶”在靖難之役燕軍攻入南京城時，被建文帝在大內乾清宮中舉火焚燬，明成祖即位後重制，並增制“誥命之寶”，在嘉靖年間統稱為“國初十七寶”建文帝於建文三年正月制凝命神寶，材料為青玉，璽文為“天命明德 表正萬方 精一執中 宇宙永昌”，方逾二尺。

“嘉靖新制七寶”、“奉天承運大明天子寶”、“大明受命之寶”、“巡狩天下之寶”、“垂訓之寶”、“命德之寶”、“討罪安民之寶”、“敕正萬民之寶”，以上八寶制於嘉靖十八年，均用玉。嘉靖四十五年冬，明世宗下詔稱“先朝甲戌（正德九年）遇災（乾清宮失火），御寶凡六，其五已遭毀。命有司覓美玉補造。”《萬曆野獲編》認為這五枚補造的玉璽之前身，實系嘉靖四十年毀於西內永壽宮火災，但嘉靖帝諱言此事，故託辭毀於正德九年。

清朝仿明制，大量製作帝王用璽以沖淡無傳國玉璽之虛。清朝玉璽使用滿漢雙文篆書樣，左滿文，右漢文。清共制二十五方玉璽稱清二十五寶。亦有聞傳國玉璽蒙元北遁時攜走，明末清初時多爾袞領兵在青海地區決戰北元時亦有得傳國玉璽，但無確實史料可證。清朝25方寶璽分別為“大清受命之寶”、“皇帝之寶”、“大清嗣天子寶”、滿文“皇帝之寶”、栴檀香木“皇帝之寶”、“天子之寶”、“皇帝尊親之寶”、“皇帝親親之寶”、 “皇帝行寶”、“皇帝信寶”、“天子行寶”、“天子信寶”、“敬天勤民之寶”、“制誥之寶”、“敕命之寶”、“垂訓之寶”、“命德之寶”、“鈐文之璽”、“表章經史之寶”、“巡狩天下之寶”、“討罪安民之寶”、“制馭六師之寶”、“敕正萬邦之寶”、“敕正萬民之寶”、“廣運之寶”。