開除，同時需要檢討公司自己的管理。

公司都面臨這樣的問題，首先是確保採購產品的價效比，價格在市場上的水平，平均中位值或偏下。這裡需要有制度和流程去管理。

斬斷採購和供應商的私下關係，不要讓供應商認為靠一兩個人就吃定企業供應。雖然有點難，但不管就會氾濫!

大宗採購和專案採取招標。日常耗品可以交由幾個長期供應商供貨，週期稽核，合同裡面有處罰及解約條款。

作為公司老闆，要從大方面抓，也需要有合理的薪酬。其實吃回扣的，影響最大的不是基層的管理者和員工，往往是中高層管理者!

適當的人情往來按國情來看待吧，畢竟中國這個社會太講究關係了。

採購方面的貓膩太多太多了，有的時候企業老闆根本看不出來，尤其專業方向的工程及裝置採購。

看了你的問題和描述，我感到很驚奇，雖說採購部是肥缺，但一個員工能夠長時間大金額的吃回扣，現在才被發現，可想而知你們公司的稽核工作、採購管理制度以及財務管理都存在問題啊。所以，這件事不是處理一個員工就能了事的，一定要治本。

對於這個偷吃回扣的採購部員工，按照你說的吃回扣金額大時間長，從法律上來講早已經是違法行為了，只要你們證據掌握充分，想不想放過這個員工就看企業的態度了，如果不想放過這個吃回扣的職員，那麼他很有可能會被你們公司送進牢裡面的。如果想放他一馬，那就找他單獨談話，亮明公司的底線，說出問題的嚴重性，收繳他所有的回扣，然後開除這樣的員工。

至於治本之法，我認為應該從公司管理方面下手治理，查漏補缺，完善採購管理制度，把好用人關，多開發備選供應商，做好稽核工作，改變採購模式，儘可能切斷吃回扣的行為。

我覺得這樣的大事，如果你發現了員工吃回扣的行為，應該及時找領導和老闆彙報此事，讓公司領導和老闆做出決策。作為下面的員工，做好執行就可以了。

在企業中，有些員工不誠實，利用工作之便吃回扣，收黑錢，即矇騙了客戶，又坑害了企業。比如採購人員在採購原材料時故意謊報價款，從中牟利，買材料只花1500元，卻報賬2000元錢，私吞公司500元。銷售人員推銷產品時，向客戶抬高產品售價，一件產品售價500元，卻賣700元，自己私吞200元，銷售過程中要求客戶給好處費等等！

員工吃回扣，收黑錢等手腳不乾淨的行為，對企業的危害是無窮的，它會嚴重影響公司的聲譽，損害公司的利益，從長遠發展來看，企業失去了客戶的信任和支援，還有什麼發展前景呢？俗話說，先做人後做事，企業用人應該首先看員工的人品，在此前提下，再尋找有能力的人才。

對於一個公司來說，員工沒有能力可以花錢，花時間慢慢培養，透過培訓和學習，員工可以從普通人才變為優秀人才，從優秀人才變成卓越者，但是員工的品德無法培養，正所謂秉性難移。一棵樹的根是爛的，你再怎麼澆水施肥，無法讓他健康成長，所以千萬不要抱有僥倖心理，任用有才無德之人，發現員工吃回扣，手腳不乾淨，一定要斬草除根，這樣才能不留後患。