地層中的化石，從其儲存特點看，可大致分為四類：實體化石、模鑄化石、遺蹟化石和化學化石。
實體化石
指古生物遺體本身幾乎全部或部分儲存下來的化石。原來的生物在特別適宜的情況下，避開了空氣的氧化和細菌的腐蝕，其硬體和軟體可以比較完整的儲存而無顯著的變化。例如猛獁象（第四紀冰期西伯利亞凍土層中於1901年發現，25000年以前，不僅骨骼完整，連皮、毛、血肉，甚至胃中食物都儲存完整）。
模鑄化石
就是生物遺體在地層或圍巖中留下的印模或復鑄物。一類是印痕，即生物遺體陷落在底層所留下的印跡，遺體往往遭受破壞，但這種印跡卻反映該生物體的主要特徵。不具硬殼的生物，在特定的地質條件下，也可儲存其軟體印痕，最常見的就是植物葉子的印痕。第二類是印模化石，包括外模和內模兩種，外模是遺體堅硬部分（如貝殼）的外表印在圍巖上的痕跡，它能夠反映原來生物外表形態及構造；內模指殼體的內面輪廓構造印在圍巖上的痕跡，能夠反映生物硬體的內部形態及構造特徵。例如貝殼埋於砂岩中，其內部空腔也被泥沙充填，當泥沙固結成巖而地下水把殼溶解之後，在圍巖與殼外表的接觸面上留下貝殼的外模，在圍巖與殼的內表面的接觸面上留下內模。第三類叫做核，上面提到的貝殼內的泥沙充填物稱為核心，它的表面就是內模，核心的形狀大小和殼內空間的性狀大小相等，是反映殼內面構造的實體。如果殼內沒有泥沙填充，當貝殼溶解後久留下一個與殼同形等大的空間，此空間如再經充填，就形成與原殼外形一致、大小相等而成分均一的實體，即稱外核。外核表面的形狀和原殼表面一樣，是由外模反印出來的，他的內部則是實心的，並不反映殼的內部特點。第四類是鑄型，當貝殼埋在沉積物中，已經形成外模及核心後，殼質全被溶解，而又被另一種礦質填入，象工藝鑄成的一樣，使填入物儲存貝殼的原形及大小，這樣就形成了鑄型。它的表面與原來貝殼的外飾一樣，它們內部還包有一個核心，但殼本身的細微構造沒有儲存。
總的來說，外模和內模所表現的紋飾凹凸情況與原物正好相反。外核與鑄型在外部形狀上和原物完全一致，但原物的內部構造被破壞消失，其物質成分與原物也不同。至於外核和鑄型的區別在於前者內部沒有核心，而後者內部還含有核心。
遺蹟化石
指保留在岩層中的古生物生活活動的痕跡和遺物。遺蹟化石中最重要的是足跡，此外還有節肢動物的爬痕，掘穴，鑽孔以及生活在濱海地帶的舌形貝所構成的潛穴，均可形成遺蹟化石。遺物化石方面，往往指動物的排洩物或卵（蛋化石）；各種動物的糞團，糞粒均可形成糞化石。中國白堊紀地層中恐龍蛋世界聞名，在山東萊陽地區以及在廣東南雄均發現成窩壘疊起來的恐龍蛋化石。
化學化石
古代生物的遺體有的雖被破壞，未儲存下來，但組成生物的有機成分經分解後形成的各種有機物如氨基酸、脂肪酸等仍可保留在岩層中，這種視之無形，但它具有一定的化學分子結構足以證明過去生物的存在的化石稱為化學化石。隨著近代化學研究的進展，科學技術的提高，古代生物的有機分子（指氨基酸等），可從岩層中分離出來，進行鑑定研究，同時產生了一門新的學科—古生物化學。
地層中的化石，從其儲存特點看，可大致分為四類：實體化石、模鑄化石、遺蹟化石和化學化石。
實體化石
指古生物遺體本身幾乎全部或部分儲存下來的化石。原來的生物在特別適宜的情況下，避開了空氣的氧化和細菌的腐蝕，其硬體和軟體可以比較完整的儲存而無顯著的變化。例如猛獁象（第四紀冰期西伯利亞凍土層中於1901年發現，25000年以前，不僅骨骼完整，連皮、毛、血肉，甚至胃中食物都儲存完整）。
模鑄化石
就是生物遺體在地層或圍巖中留下的印模或復鑄物。一類是印痕，即生物遺體陷落在底層所留下的印跡，遺體往往遭受破壞，但這種印跡卻反映該生物體的主要特徵。不具硬殼的生物，在特定的地質條件下，也可儲存其軟體印痕，最常見的就是植物葉子的印痕。第二類是印模化石，包括外模和內模兩種，外模是遺體堅硬部分（如貝殼）的外表印在圍巖上的痕跡，它能夠反映原來生物外表形態及構造；內模指殼體的內面輪廓構造印在圍巖上的痕跡，能夠反映生物硬體的內部形態及構造特徵。例如貝殼埋於砂岩中，其內部空腔也被泥沙充填，當泥沙固結成巖而地下水把殼溶解之後，在圍巖與殼外表的接觸面上留下貝殼的外模，在圍巖與殼的內表面的接觸面上留下內模。第三類叫做核，上面提到的貝殼內的泥沙充填物稱為核心，它的表面就是內模，核心的形狀大小和殼內空間的性狀大小相等，是反映殼內面構造的實體。如果殼內沒有泥沙填充，當貝殼溶解後久留下一個與殼同形等大的空間，此空間如再經充填，就形成與原殼外形一致、大小相等而成分均一的實體，即稱外核。外核表面的形狀和原殼表面一樣，是由外模反印出來的，他的內部則是實心的，並不反映殼的內部特點。第四類是鑄型，當貝殼埋在沉積物中，已經形成外模及核心後，殼質全被溶解，而又被另一種礦質填入，象工藝鑄成的一樣，使填入物儲存貝殼的原形及大小，這樣就形成了鑄型。它的表面與原來貝殼的外飾一樣，它們內部還包有一個核心，但殼本身的細微構造沒有儲存。
總的來說，外模和內模所表現的紋飾凹凸情況與原物正好相反。外核與鑄型在外部形狀上和原物完全一致，但原物的內部構造被破壞消失，其物質成分與原物也不同。至於外核和鑄型的區別在於前者內部沒有核心，而後者內部還含有核心。
遺蹟化石
指保留在岩層中的古生物生活活動的痕跡和遺物。遺蹟化石中最重要的是足跡，此外還有節肢動物的爬痕，掘穴，鑽孔以及生活在濱海地帶的舌形貝所構成的潛穴，均可形成遺蹟化石。遺物化石方面，往往指動物的排洩物或卵（蛋化石）；各種動物的糞團，糞粒均可形成糞化石。中國白堊紀地層中恐龍蛋世界聞名，在山東萊陽地區以及在廣東南雄均發現成窩壘疊起來的恐龍蛋化石。
化學化石
古代生物的遺體有的雖被破壞，未儲存下來，但組成生物的有機成分經分解後形成的各種有機物如氨基酸、脂肪酸等仍可保留在岩層中，這種視之無形，但它具有一定的化學分子結構足以證明過去生物的存在的化石稱為化學化石。隨著近代化學研究的進展，科學技術的提高，古代生物的有機分子（指氨基酸等），可從岩層中分離出來，進行鑑定研究，同時產生了一門新的學科—古生物化學。