絕大多數降糖藥物都會對人體產生副作用，如，磺脲類藥物和格列奈類藥物容易造成肝損傷;雙胍類藥物最主要的副作用是容易引起胃腸道反應以及乳酸中毒，少部分服用者會出現過敏性反應以及大細胞性貧血反應等。α-葡萄糖苷酶抑制劑最主要的副作用是容易引起胃腸道反應，患者服藥後會有腹脹、腹痛、腹瀉和腸排氣過多等現象，有報道說個別患者在服用此類後還出現了嚴重的肝損害。胰島素增敏劑也會對服藥者的肝臟造成損害，還可能增加其血容量，加重其心臟的負擔。 為了避免和最大程度的降低降糖藥物的副作用，糖尿病患者應選擇適合自己的降糖藥物，合理地選擇服藥的時間及服藥的方式。 具體措施如下：磺脲類藥物和格列奈類藥物，最好在飯前半個小時服用，有嚴重肝腎功能不全的糖尿病患者、有糖尿病急慢性併發症的患或者處於妊娠期、哺乳期的糖尿病患者，應禁服此類藥物。 雙胍類藥物應在飯中或飯後服用，以降低此類藥物對消化道的副作用。嚴重貧血患者、肝腎功能不全的患者應禁止服用雙胍類藥物。 α-葡萄糖苷酶抑制劑需要同第一口飯一起嚼服，以達到藥物的最佳療效;患有胃腸道疾病、腎功能不全以及處於妊娠期、哺乳期的患者，應禁服此類藥物。 肝腎功能不全和心臟功能不全的糖尿病患者，應慎用胰島素增敏劑。