這本書繼續講述了哈利波特在霍格沃茨魔法學校的學習生活。第二學年中一些新人物或者原來只出現過一次的人物閃亮登場了，比如多比、桃金娘、吉德羅·洛哈特、科林·克里維還有金妮·韋斯萊。
暑假中，盧修斯·馬爾福的家養小精靈多比警告哈利波特說若哈利回學校上課那麼會處於非常危險的境地，不過哈利沒有理睬這個警告，並努力懇請多比不要使用魔法。德思禮一家把哈利當作罪犯，把他鎖起，直到韋斯萊一家用飛天汽車把他解救出來。哈利和他的好朋友羅恩·韋斯萊度過了一個愉快的暑假。返校的日子到了，韋斯萊一家來到車站，但是哈利和羅恩無論如何都無法進入停靠著霍格沃茨特快火車的九又四分之三站臺，無奈之下，他們只好駕駛飛天汽車去學校。不過，他們在學校著陸時墜毀，人員沒有傷亡，汽車卻報廢了，羅恩的魔杖也被折斷，損壞了。
有三個人引起了哈利的注意：新的喜歡虛榮的黑魔法防禦術老師吉德羅·洛哈特、一直仰慕哈利的科林·克里維、喜歡攝影的可愛女孩——羅恩的妹妹金妮·韋斯萊。
但是，當密室開啟之後，學校裡面變得一團糟，襲擊事件接連發生，有些學生竟被變成了石頭，兇手是誰一直無法查出。相傳，學校創辦人之一薩拉查·斯萊特林曾經在學校裡面建造了一個隱藏的密室，只有他或者斯萊特林的繼承人才知道如何並可以進入，這個密室是為了清除學校中血統不純的學生而建造的。一時間，人們紛紛認為哈利波特是斯萊特林繼承人，是兇手，尤其是哈利是一個蛇佬腔（可以和蛇說話，而蛇正是斯萊特林的象徵）之後，大家更是這麼認為。而整個故事的主線就是，哈利、羅恩、赫敏三個人尋找密室的入口和真正的斯萊特林人。
襲擊事件接連發生，包括赫敏在內的有一些學生被石化，送往醫院。一天，金妮被抓進了密室——學校裡面的一段牆上留下了“她的屍骨將永遠留在密室”字樣，危急的時刻到了。
在羅恩的幫助下，哈利終於發現了密室的入口，並且成功進入了密室，而他發現，開啟密室造成襲擊的人是金妮，不過金妮是被控制了而做出這種事情的，是伏地魔（斯萊特林的繼承人，史上最為邪惡的巫師）控制了她。伏地魔在上學的時候名字叫做湯姆·裡德爾，他的一個魂器HP6湯姆·裡德爾的日記使金妮受到了控制。
湯姆·裡德爾存在日記中的靈魂由於偷去了金妮的生命而強大起來，他放出了蛇怪（能夠使人石化的怪物）對抗哈利，千鈞一髮之時，阿不思·鄧布利多的鳳凰FOCUS為哈利送來了戈德里克·格蘭芬多（學校創始人之一）的劍，FOCUS啄瞎了蛇怪，使它無法石化哈利，哈利用劍殺死了蛇怪。湯姆·裡德爾敗陣下來，金妮恢復了生命，魂器HP6-日記被哈里毀掉。這本日記是盧修斯·馬爾福在開學之前偷偷藏在金妮的書袋中的，但是哈利不掌握能證明這一點的證據，不能指控盧修斯·馬爾福，哈利把一隻舊襪夾在殘破的日記中交給盧修斯·馬爾福，盧修斯非常生氣，順手把裝有日記連同其中的舊襪子拋給了他的家養小精靈多比，按照傳統慣例，主人把衣物送給家養小精靈代表給予它們自由，因為襪子好歹也算做衣物，所以多比就自由了，它非常感激哈利。
吉德羅·洛哈特其實只會吹噓、沒有真正本領這一點被哈利和羅恩發現，當吉德羅想要加害於他們時卻因為誤使了羅恩的損壞了的、會回火的魔杖而令自己失憶，後來一直生活在醫院中。顯然，它不能繼續擔任黑魔法防禦術老師。
這本書繼續講述了哈利波特在霍格沃茨魔法學校的學習生活。第二學年中一些新人物或者原來只出現過一次的人物閃亮登場了，比如多比、桃金娘、吉德羅·洛哈特、科林·克里維還有金妮·韋斯萊。
暑假中，盧修斯·馬爾福的家養小精靈多比警告哈利波特說若哈利回學校上課那麼會處於非常危險的境地，不過哈利沒有理睬這個警告，並努力懇請多比不要使用魔法。德思禮一家把哈利當作罪犯，把他鎖起，直到韋斯萊一家用飛天汽車把他解救出來。哈利和他的好朋友羅恩·韋斯萊度過了一個愉快的暑假。返校的日子到了，韋斯萊一家來到車站，但是哈利和羅恩無論如何都無法進入停靠著霍格沃茨特快火車的九又四分之三站臺，無奈之下，他們只好駕駛飛天汽車去學校。不過，他們在學校著陸時墜毀，人員沒有傷亡，汽車卻報廢了，羅恩的魔杖也被折斷，損壞了。
有三個人引起了哈利的注意：新的喜歡虛榮的黑魔法防禦術老師吉德羅·洛哈特、一直仰慕哈利的科林·克里維、喜歡攝影的可愛女孩——羅恩的妹妹金妮·韋斯萊。
但是，當密室開啟之後，學校裡面變得一團糟，襲擊事件接連發生，有些學生竟被變成了石頭，兇手是誰一直無法查出。相傳，學校創辦人之一薩拉查·斯萊特林曾經在學校裡面建造了一個隱藏的密室，只有他或者斯萊特林的繼承人才知道如何並可以進入，這個密室是為了清除學校中血統不純的學生而建造的。一時間，人們紛紛認為哈利波特是斯萊特林繼承人，是兇手，尤其是哈利是一個蛇佬腔（可以和蛇說話，而蛇正是斯萊特林的象徵）之後，大家更是這麼認為。而整個故事的主線就是，哈利、羅恩、赫敏三個人尋找密室的入口和真正的斯萊特林人。
襲擊事件接連發生，包括赫敏在內的有一些學生被石化，送往醫院。一天，金妮被抓進了密室——學校裡面的一段牆上留下了“她的屍骨將永遠留在密室”字樣，危急的時刻到了。
在羅恩的幫助下，哈利終於發現了密室的入口，並且成功進入了密室，而他發現，開啟密室造成襲擊的人是金妮，不過金妮是被控制了而做出這種事情的，是伏地魔（斯萊特林的繼承人，史上最為邪惡的巫師）控制了她。伏地魔在上學的時候名字叫做湯姆·裡德爾，他的一個魂器HP6湯姆·裡德爾的日記使金妮受到了控制。
湯姆·裡德爾存在日記中的靈魂由於偷去了金妮的生命而強大起來，他放出了蛇怪（能夠使人石化的怪物）對抗哈利，千鈞一髮之時，阿不思·鄧布利多的鳳凰FOCUS為哈利送來了戈德里克·格蘭芬多（學校創始人之一）的劍，FOCUS啄瞎了蛇怪，使它無法石化哈利，哈利用劍殺死了蛇怪。湯姆·裡德爾敗陣下來，金妮恢復了生命，魂器HP6-日記被哈里毀掉。這本日記是盧修斯·馬爾福在開學之前偷偷藏在金妮的書袋中的，但是哈利不掌握能證明這一點的證據，不能指控盧修斯·馬爾福，哈利把一隻舊襪夾在殘破的日記中交給盧修斯·馬爾福，盧修斯非常生氣，順手把裝有日記連同其中的舊襪子拋給了他的家養小精靈多比，按照傳統慣例，主人把衣物送給家養小精靈代表給予它們自由，因為襪子好歹也算做衣物，所以多比就自由了，它非常感激哈利。
吉德羅·洛哈特其實只會吹噓、沒有真正本領這一點被哈利和羅恩發現，當吉德羅想要加害於他們時卻因為誤使了羅恩的損壞了的、會回火的魔杖而令自己失憶，後來一直生活在醫院中。顯然，它不能繼續擔任黑魔法防禦術老師。