阿壩州13個縣的分別是：馬爾康市、九寨溝縣、小金縣、阿壩縣、若爾蓋縣、紅原縣、壤塘縣、汶川縣、理縣、茂縣、松潘縣、金川縣、黑水縣。

1、汶川縣

汶川縣隸屬於四川省阿壩藏族自治州，位於青藏高原東部邊緣、四川省西北部，居川西北高原和阿壩藏族羌族自治州東南部，東西寬84公里，南北長105公里，總面積4084平方公里，縣城海拔1236米。

南距省會成都146公里，北離州府馬爾康202公里，區位優勢明顯，交通便利。轄威州、綿虒、映秀、漩口、水磨、臥龍、三江、耿達8鎮，龍溪、克枯、雁門、銀杏4鄉。

2、理縣

理縣位於青藏高原東緣，阿壩藏族羌族自治州東南部，地處北緯30°54′-31°12′，東經102°32′-103°30′。東北與茂縣、黑水接壤，西南與小金相連，東南與汶川相通，西北與馬爾康、紅原毗鄰，距省會成都202公里，距州府馬爾康193公里，縣城海拔1888米。

3、茂縣

茂縣是四川省阿壩藏族羌族自治州下轄縣，位於四川省西北部、阿壩藏族羌族自治州東南部的青藏高原東南邊緣，地理座標為東經102°56′～104°10′，北緯31°25′～32°16′，地跨岷江和涪江上游高山河谷地帶，東西長116.62千米，南北寬93.73千米，幅員面積3903.28平方公里。

4、松潘縣

松潘縣，四川省阿壩藏族羌族自治州轄縣。位於青藏高原東緣，阿壩藏族羌族自治州東北部，行政區域面積8486平方公里，人口74945人（2015年），轄2個鎮、23個鄉，縣人民政府駐進安鎮。

5、九寨溝縣

九寨溝縣，隸屬於四川省阿壩藏族羌族自治州，位於青藏高原東部邊緣，阿壩州東北部。東、北與甘肅省文縣、舟曲縣、迭部縣交界，西、南與四川省若爾蓋縣、平武縣、松潘縣接壤。

6、金川縣

金川縣原名靖化縣，位於川西北高原，阿壩藏族羌族自治州西南部，地處青藏高原東部邊緣，大渡河上游，隸屬四川省阿壩州。金川縣因境內河流大金川（大渡河上游）得名，而大金川因沿河諸山有金礦得名。

7、小金縣

小金縣為四川省阿壩藏族羌族自治州下轄縣。藏名贊拉，凶神之意。因境內小金川得名。 小金縣地處青藏高原東部邊緣，位於四川省西北部，在阿壩藏族羌族自治州南部。東鄰汶川縣，西毗甘孜州丹巴縣，南連雅安市寶興縣，北接馬爾康縣。

8、黑水縣

黑水，地處青藏高原東部，阿壩藏族羌族自治州中部，北與松潘相接，東西與紅原、茂縣相鄰，南和西南與理縣、馬爾康相連，距離省會成都284公里，縣城海拔2350米。黑水藏名為“措曲”，是“生鐵之水”之意。黑水河屬岷江上游支流。有小黑水河、毛爾蓋河及溪溝99條。

9、馬爾康市（原馬爾康縣）

馬爾康市（原馬爾康縣），是四川省阿壩藏族羌族自治州管轄的縣級市，亦是該州首府，藏語意為“火苗旺盛的地方”，引申為“興旺發達之地”。馬爾康是以原嘉絨18土司中卓克基、松崗、黨壩、梭磨四個土司屬地為雛形建立起來的，亦稱“四土地區”。

阿壩州幅員面積83,426平方公里，轄1市12縣（馬爾康市、九寨溝縣、小金縣、阿壩縣、若爾蓋縣、紅原縣、壤塘縣、汶川縣、理縣、茂縣、松潘縣、金川縣、黑水縣），行政中心駐地馬爾康市。阿壩州是四川省第二大藏區和中國羌族的主要聚居區。