標本的選擇應根據感染部位而異，可取痰、支氣管灌洗液、尿、糞、腦脊液或胸腔積液、腹腔積液、分泌液或組織細胞。結核患者各感染部位的標本中大多數混有其他細菌，因此，必須採取適宜的方法抑制汙染菌。

痰收集最好是患者清晨的第一口痰，置於清潔乾燥無菌的玻璃瓶內送檢。尿液收集應取晨尿送檢，必要時作無菌導尿送檢，診斷泌尿道結核通常需3～5份標本。胃液採集可於空腹時抽取，置無菌管中送檢。腦脊液、胸腔積液、腹腔積液及關節液等需無菌抽取並置於無菌試管中送檢。

腦脊液標本靜置後，表面可有細薄凝塊，取凝塊作塗片或接種培養。採集膿液時應直接從潰瘍處取膿汁或分泌物。深部膿腫用無菌注射器抽取，置無菌試管中送檢。棉拭子採集的標本應直接放置在肉湯中培養。

形態學檢查方法：

(1)直接塗片染色鏡檢：用接種環取患者痰液中濃厚部分或離心沉澱的尿沉澱物2～3接種環塗片，作厚塗片進行齊-尼抗酸染色。為提高鏡檢敏感性，也可用金胺“O”染色，在熒光顯微鏡下結核分枝桿菌呈現金黃色熒光。

鏡檢時應仔細查遍整個塗片或觀察至少100個視野。結核分枝桿菌抗酸染色後呈紅色，其他細菌和細胞為藍色。經免疫熒光染色的結核分枝桿菌，在黑色背景中呈亮黃色。塗片鏡檢結果應報告“找到抗酸桿菌或未找到抗酸桿菌”。

擴充套件資料：

結核分枝桿菌的培養特性：

結核分枝桿菌專性需氧。最適溫度為37℃，低於30℃不生長。結核分枝桿菌細胞壁的脂質含量較高，影響營養物質的吸收，故生長緩慢。在一般培養基中每分裂1代需時18～24小時，營養豐富時只需5小時。

初次分離需要營養豐富的培養基。常用的有羅氏（Lowenstein-Jensen）固體培養基，內含蛋黃、甘油、馬鈴薯、無機鹽和孔雀綠等。孔雀綠可抑制雜菌生長，便於分離和長期培養。蛋黃含脂質生長因子，能刺激生長。

根據接種菌多少，一般2～4周可見菌落生長。菌落呈顆粒、結節或花菜狀，乳白色或米黃色，不透明。在液體培養基中可能由於接觸營養面大，細菌生長較為迅速。一般1～2周即可生長。臨床標本檢查液體培養比固體培養的陽性率高數倍。