菸草危害健康是不爭的醫學結論。全球每年因吸菸導致的死亡人數高達600萬人，超過艾滋病、結核、瘧疾導致死亡人數總和。菸草中含有69種致癌物，有充分證據表明，吸菸可以導致肺癌、口腔癌、鼻咽部惡性腫瘤、喉癌、食管癌、胃癌、肝癌、胰腺癌、腎癌、膀胱癌和宮頸癌。還有證據提示吸菸可以導致結直腸癌、乳腺癌和急性白血病。

吸菸可導致多種呼吸道疾病。有充分證據表明吸菸可以導致慢性阻塞性肺部疾病和青少年哮喘，增加肺結核和其他呼吸道感染的發病機會。

吸菸損傷血管內皮功能。有充分證據說明吸菸導致冠心病、腦卒中和外周動脈疾病，戒菸可顯出降低這些疾病的發病和死亡風險。

吸菸會損傷遺傳物質，對內分泌系統、輸卵管功能、胎盤功能、免疫功能、孕婦及胎兒心血管系統及胎兒組織器官發育造成不良影響。有充分證據表明女性吸菸可以降低受孕機會，導致前置胎盤、胎盤早剝、胎兒生長受限、新生兒低出生體重及嬰兒猝死綜合徵。此外，吸菸還可導致異位妊娠和自然流產。吸菸還可導致男性勃起功能障礙。

吸菸導致髖部骨折、牙周炎、白內障、手術傷口癒合不良以及手術後呼吸系統併發症、面板老化。幽門螺旋桿菌感染者可以導致消化性潰瘍。有充分證據表明吸菸可以導致牙周炎和核性白內障。

此外，吸菸還可導致2型糖尿病，並可增加糖尿病患者發生大血管和微血管併發症的風險，影響疾病預後。

吸菸是人類最大的可預防的致病致死因素，吸菸者減少吸菸量並不降低其發病和死亡的風險，也不能獲得健康益處，而戒菸才是降低吸菸對健康危害的唯一方法。研究表明，與持續吸菸相比，在65、50、40、30歲戒菸，則分別能延長3、6、9和10年預期壽命。