劇場版3：《世紀末的魔術師中》劇情介紹：在城堡中，柯南意外發現通往地下室的通道，在秘道中珠寶商乾被殺。而其他人在一個棺木中發現了第二個蛋，並明白了回憶之卵的真正含義。但專門狙擊人右眼的神秘殺手“史考兵”也在人群之中。他再次行動，目標是小五郎和小蘭，刺殺失敗後兇手搶走了彩蛋，並想燒燬城堡。柯南追趕兇手，在熊熊大火中，兇手露出了她的真面目。柯南在白鳥的幫助下逃出了火海。回家後小蘭對柯南的真實身份再次起了疑問，正當柯南要說出真相時，新一出現了...劇場版4：《瞳孔中的暗殺者》劇情簡介：毛利小五郎、柯南和眾多警察參加白鳥警官妹妹的婚宴，席間突然停電，小蘭和佐藤美和子警官都在廁所中，正當小蘭拿起身旁的手電筒時槍聲卻響起，而佐藤警官也為了保護小蘭而挨槍。聽到槍聲的小五郎等人湧入廁所時犯人卻已不留痕跡地脫逃了。這時，小蘭卻因承受不了佐藤警官重傷昏迷的打擊，從而患了逆性健忘！雖然記不起身邊的事，但卻可以照顧自己的日常生活。失去記憶的蘭不斷受到犯人的攻擊，為了找回記憶，眾人帶蘭去熱帶公園，卻誤認為找到真兇而放鬆警惕。此時，找出真兇的柯南趕往樂園保護蘭，最後在噴水池中，蘭開始回憶起了和工藤新一的往事...劇場版7：《迷宮的十字路口》劇情簡介：在東京某個位於西國立市的神社內，有三名可疑的男子正在密談。突然有個戴著假面具的黑影男人出現，用日本刀和弓箭在瞬間將三人殺害；與此事件同時，大阪、京都也相繼發生了殺人事件。小五郎帶著柯南、小蘭和園子來到了京都。八年前，位於京都的古老寺院——山能寺中的一尊國寶級佛像遭到偷竊，寺院的住持委託他們解讀一幅可以判斷佛像藏匿地點的謎樣的畫像，因而請來了小五郎幫忙。瞬間躲過襲擊的柯南，看到那名男子後感到十分驚奇。那個男子竟是與工藤新一併稱的西部高中生偵探——服部平次，同時也是少數知道柯南就是工藤新一的人物之一。他也是為了追尋在大阪發生的竊盜集團成員被殺事件的真相而到達京都，總是在較勁的柯南與平次，這次為了查出事件的真相，決定聯手進行調查，但是，兩人萬萬沒想到，戴著面具的黑影男人居然就出現在他們面前。劇場版9：《水平線上的陰謀》劇情簡介：15年前的一個霧色濃稠的夜晚，在北大西洋的海上一艘正在航行中的貨輪“第一八代丸”，撞上了前方巨大冰川發生事故沉沒。萬幸的是船上大部分人都逃過這一劫難，只有船長和一名船上的高階幹部不幸罹難身亡。為了不影響乘客的情緒，船上的晚宴仍然如期舉辦。在柯南的努力下，真相即將被揭發時卻突然發生了重大意外，油輪的機房發生了大爆炸。犯人更在整艘油輪的主要機房內都安置了炸彈，整個船身不停搖晃，讓船員和乘客都驚恐萬分，全船600條人命，就懸於瘋狂的犯人一念之間。置身於無處可逃的大海上，引起了極大的恐慌和混亂，人們陷入了極度的不安中。更糟糕的是，這次連小蘭也被捲入了危險裡面，當然，片子的結果，依舊是正義戰勝邪惡，柯南用他名偵探的推理救出了小蘭，不過出人意料的是，這次掌握事件關鍵的，卻是新一和小蘭超越了時間的羈絆...劇場版12：《戰慄的樂譜》劇情簡介：不久之前發生了以音樂家為襲擊目標的連續殺人事件，被害人均出身於原著名鋼琴家領銜建立的一所音樂學院。柯南等一行人，受到了這位鋼琴家的邀請，出席由他出資建造的音樂廳的落成典禮音樂會。音樂會的亮點是巴赫彈奏過的管風琴和世界著名的斯特拉迪瓦里琴的音色，以及擁有絕對音感的天才歌手的歌聲。可是，在音樂會正式舉辦前，陸續發生了許多可疑案件。而正式演出當天，柯南他們所在的音樂會會場突然發生了爆炸，陷入一片火海...
劇場版3：《世紀末的魔術師中》劇情介紹：在城堡中，柯南意外發現通往地下室的通道，在秘道中珠寶商乾被殺。而其他人在一個棺木中發現了第二個蛋，並明白了回憶之卵的真正含義。但專門狙擊人右眼的神秘殺手“史考兵”也在人群之中。他再次行動，目標是小五郎和小蘭，刺殺失敗後兇手搶走了彩蛋，並想燒燬城堡。柯南追趕兇手，在熊熊大火中，兇手露出了她的真面目。柯南在白鳥的幫助下逃出了火海。回家後小蘭對柯南的真實身份再次起了疑問，正當柯南要說出真相時，新一出現了...劇場版4：《瞳孔中的暗殺者》劇情簡介：毛利小五郎、柯南和眾多警察參加白鳥警官妹妹的婚宴，席間突然停電，小蘭和佐藤美和子警官都在廁所中，正當小蘭拿起身旁的手電筒時槍聲卻響起，而佐藤警官也為了保護小蘭而挨槍。聽到槍聲的小五郎等人湧入廁所時犯人卻已不留痕跡地脫逃了。這時，小蘭卻因承受不了佐藤警官重傷昏迷的打擊，從而患了逆性健忘！雖然記不起身邊的事，但卻可以照顧自己的日常生活。失去記憶的蘭不斷受到犯人的攻擊，為了找回記憶，眾人帶蘭去熱帶公園，卻誤認為找到真兇而放鬆警惕。此時，找出真兇的柯南趕往樂園保護蘭，最後在噴水池中，蘭開始回憶起了和工藤新一的往事...劇場版7：《迷宮的十字路口》劇情簡介：在東京某個位於西國立市的神社內，有三名可疑的男子正在密談。突然有個戴著假面具的黑影男人出現，用日本刀和弓箭在瞬間將三人殺害；與此事件同時，大阪、京都也相繼發生了殺人事件。小五郎帶著柯南、小蘭和園子來到了京都。八年前，位於京都的古老寺院——山能寺中的一尊國寶級佛像遭到偷竊，寺院的住持委託他們解讀一幅可以判斷佛像藏匿地點的謎樣的畫像，因而請來了小五郎幫忙。瞬間躲過襲擊的柯南，看到那名男子後感到十分驚奇。那個男子竟是與工藤新一併稱的西部高中生偵探——服部平次，同時也是少數知道柯南就是工藤新一的人物之一。他也是為了追尋在大阪發生的竊盜集團成員被殺事件的真相而到達京都，總是在較勁的柯南與平次，這次為了查出事件的真相，決定聯手進行調查，但是，兩人萬萬沒想到，戴著面具的黑影男人居然就出現在他們面前。劇場版9：《水平線上的陰謀》劇情簡介：15年前的一個霧色濃稠的夜晚，在北大西洋的海上一艘正在航行中的貨輪“第一八代丸”，撞上了前方巨大冰川發生事故沉沒。萬幸的是船上大部分人都逃過這一劫難，只有船長和一名船上的高階幹部不幸罹難身亡。為了不影響乘客的情緒，船上的晚宴仍然如期舉辦。在柯南的努力下，真相即將被揭發時卻突然發生了重大意外，油輪的機房發生了大爆炸。犯人更在整艘油輪的主要機房內都安置了炸彈，整個船身不停搖晃，讓船員和乘客都驚恐萬分，全船600條人命，就懸於瘋狂的犯人一念之間。置身於無處可逃的大海上，引起了極大的恐慌和混亂，人們陷入了極度的不安中。更糟糕的是，這次連小蘭也被捲入了危險裡面，當然，片子的結果，依舊是正義戰勝邪惡，柯南用他名偵探的推理救出了小蘭，不過出人意料的是，這次掌握事件關鍵的，卻是新一和小蘭超越了時間的羈絆...劇場版12：《戰慄的樂譜》劇情簡介：不久之前發生了以音樂家為襲擊目標的連續殺人事件，被害人均出身於原著名鋼琴家領銜建立的一所音樂學院。柯南等一行人，受到了這位鋼琴家的邀請，出席由他出資建造的音樂廳的落成典禮音樂會。音樂會的亮點是巴赫彈奏過的管風琴和世界著名的斯特拉迪瓦里琴的音色，以及擁有絕對音感的天才歌手的歌聲。可是，在音樂會正式舉辦前，陸續發生了許多可疑案件。而正式演出當天，柯南他們所在的音樂會會場突然發生了爆炸，陷入一片火海...