原東湧鎮
南北朝時（公元420～581年），番禺沙灣、茭塘兩司還“地邊多海”，沙灣以南（即靈山、魚窩頭、東湧、潭洲一帶）未見有居民居住點的記載，處在茫茫大海之中，是水深6～7米的淺海。
北宋末年（公元1127年），金兵南侵和南宋末年元兵入侵，中原人士大量移民南下，番禺沙灣以南（即靈山、魚窩頭、東湧、潭洲一帶）的沙灘由人工堤圍的修建而加速形成。
清代，屬沙灣都。
民國時期，屬第一區。
建國初期，為沙鼻鄉。
1953年，今鎮境為東湧、石排、石基3個行政鄉。
1957年，撤區，併為東湧鄉。
1958年1月，併入魚窩頭鄉。
1958年至1961年上半年，先後屬靈山和魚窩頭公社。
1961年7月，從魚窩頭公社析出為東湧公社。
1984年，為東湧區。
1987年，為東湧鎮。
原魚窩頭鎮
明代，從東湧石基村沙頭至大穩沙鼻樑、南涌村沙鼻寨一帶，逐漸出現一個形似鼻子的沙洲（或沙丘），叫“沙鼻沙”或“沙鼻山”。
建國初期，屬沙九螺區聯鄉辦事處所轄的濠下、大烏鄉。
1953年，屬第二區。
1957年，靈山區撤銷，為魚窩頭鄉。
1958年10月，併入靈山團。
1959年3月，從靈山公社析出為魚窩頭公社。
1961年7月，析騮崗水道以東為東湧公社。
1984年，為魚窩頭區。
1987年，為魚窩頭鎮。
原西樵村
據記載，西樵湧西岸北斗圍於1876年築圍，大坳圍及西樵圍於1776年築圍。西樵建村至今已有100多年曆史。
1949～1952年，屬欖核鄉管轄。
1952年下半年，屬大烏鄉管轄。
1953年，屬雙翼鄉管轄。
1954～-2006年1月25日，屬靈山管轄。
2006年1月25日，番禺行政區域調整後，由原來的靈山鎮劃出併入東湧鎮。
合併建鎮
2006年1月25日，魚窩頭和靈山西樵村併入東湧鎮。
2012年12月1日，東湧鎮由番禺區劃入南沙區管轄。
原東湧鎮
南北朝時（公元420～581年），番禺沙灣、茭塘兩司還“地邊多海”，沙灣以南（即靈山、魚窩頭、東湧、潭洲一帶）未見有居民居住點的記載，處在茫茫大海之中，是水深6～7米的淺海。
北宋末年（公元1127年），金兵南侵和南宋末年元兵入侵，中原人士大量移民南下，番禺沙灣以南（即靈山、魚窩頭、東湧、潭洲一帶）的沙灘由人工堤圍的修建而加速形成。
清代，屬沙灣都。
民國時期，屬第一區。
建國初期，為沙鼻鄉。
1953年，今鎮境為東湧、石排、石基3個行政鄉。
1957年，撤區，併為東湧鄉。
1958年1月，併入魚窩頭鄉。
1958年至1961年上半年，先後屬靈山和魚窩頭公社。
1961年7月，從魚窩頭公社析出為東湧公社。
1984年，為東湧區。
1987年，為東湧鎮。
原魚窩頭鎮
明代，從東湧石基村沙頭至大穩沙鼻樑、南涌村沙鼻寨一帶，逐漸出現一個形似鼻子的沙洲（或沙丘），叫“沙鼻沙”或“沙鼻山”。
清代，屬沙灣都。
民國時期，屬第一區。
建國初期，屬沙九螺區聯鄉辦事處所轄的濠下、大烏鄉。
1953年，屬第二區。
1957年，靈山區撤銷，為魚窩頭鄉。
1958年10月，併入靈山團。
1959年3月，從靈山公社析出為魚窩頭公社。
1961年7月，析騮崗水道以東為東湧公社。
1984年，為魚窩頭區。
1987年，為魚窩頭鎮。
原西樵村
據記載，西樵湧西岸北斗圍於1876年築圍，大坳圍及西樵圍於1776年築圍。西樵建村至今已有100多年曆史。
1949～1952年，屬欖核鄉管轄。
1952年下半年，屬大烏鄉管轄。
1953年，屬雙翼鄉管轄。
1954～-2006年1月25日，屬靈山管轄。
2006年1月25日，番禺行政區域調整後，由原來的靈山鎮劃出併入東湧鎮。
合併建鎮
2006年1月25日，魚窩頭和靈山西樵村併入東湧鎮。
2012年12月1日，東湧鎮由番禺區劃入南沙區管轄。