建立準噶爾汗國的準噶爾部落是屬於蒙古族的一支--衛拉特蒙古，這個歷史悠久的部族，在各個歷史時期有不同的稱謂，元朝稱翰亦剌惕，明代稱瓦剌，清代稱衛拉特，亦稱厄魯特、額魯特或西蒙古、漠西蒙古。國外則稱之為卡爾梅克。明末清初之際，衛拉特蒙古分為和碩特、準噶爾、杜爾博特、土爾扈特四大部落。

1634年，準噶爾部的首領哈喇忽剌去世，其子巴圖爾繼承了他的事業，不斷擴大自己的領土，並在1638年在博克塞裡（今博克賽爾蒙古自治縣）建成自己的都城，1640年，制定了《衛拉特法典》，正式建立了準噶爾汗國，巴圖爾被稱為巴圖爾琿臺吉，連續兩次擊退俄國的侵略，迫使俄國承認了自己的獨立並與之建立了外交關係，兩國互通貿易。大家知道，清朝是在1644年建立，準噶爾汗國要比他早立國4年。1648年，巴圖爾琿臺吉授命喇嘛咱雅班第達將過去的蒙文改造而制定成“託沁”文字，作為準噶爾汗國的統一文字。

1653年，巴圖爾琿臺吉去世，其第五子僧格繼承汗位，但其眾兄弟不服，起兵反叛，內戰爆發，至十七世紀六十年代，僧格才平定了叛亂，但在1671年，他就被自己的兩個哥哥--車臣和卓特巴巴圖爾暗殺，他的三個兒子都年小，汗位難以得到延續，在汗國將要陷入分裂時，正在西藏學習佛學的噶爾丹（僧格的同母弟）徵得老師--五世達賴喇嘛的同意還俗。用極快的速度回國，在和碩特首領鄂齊爾圖車臣汗的援助下，擒殺了車臣，並將卓特巴巴圖爾趕往青海，使國家恢復安定，他自己成為準噶爾汗國的新一代大汗，稱為“博碩克圖汗”。但是，由於他的即位是建立在和碩特首領鄂齊爾圖車臣汗的幫助之上，汗國實際上有一半的領土在鄂齊爾圖車臣汗的控制之下，為了鞏固自己的權利，噶爾丹經過多年戰爭，擊敗了鄂齊爾圖車臣汗，使汗國內部形成了以他為首的綽羅斯家族的政權。

歷史自從1206年成吉思汗成立蒙古帝國開始，這個國家的民族只奉行一條：戰爭和撤退，從來沒有投降的道理。1368年，在大明軍隊如日中天的攻勢之後，元順帝帶領自己的殘兵敗將逃回了蒙古高原。然而終明一朝，即使蒙古一分為二變成韃靼和瓦剌，也沒有真正吃掉蒙古帝國。生活在這個地方的人打心眼裡就不服從來自中原王朝的管教。

準噶爾汗國的前身是和明朝對峙的蒙古瓦剌部，後來瓦剌部在崛起的蒙古韃靼部打擊下向西遷移併發生分裂，在歷史上又被稱為衛拉特部，下面又分為準噶爾部、和碩特部、土爾扈特部和杜爾伯特部四部，也稱為漠西蒙古。

十七世紀初，準噶爾部迅速擴張，宣戰其他三個部落，把他們趕到了伏爾加河地區，在經過數年的東征西討後，終於在 1678年統一漠西蒙古，建立準噶爾汗國。

1616年努爾哈赤在赫圖阿拉稱汗，建立大金1636年，皇太極改國號為“大清”，清朝正式建立。準格爾汗國和大清國建立的時間差不多，一個在西北一個在東北。

從地圖上可以看出，葛爾丹的汗國當時土地達到七百萬平方公里，而清朝也不過幾百萬平方公里而已。雖然清朝佔領的是富饒的中原，但是蒙古苦寒地區更能產出優秀的戰士。而此時的葛爾丹，同樣是不世英才，豈能把當年成吉思汗消滅過的女真人放在眼裡。

從康熙二十九年（1690年）烏蘭木通之戰，到乾隆二十四年（1759年）清朝徹底平定天山南北，清朝三代帝王，用了將近70年的時間，最終消滅準噶爾汗國，實現了對西域的征服。至此，這個常年與清朝為敵的強大勢力，徹底被征服。

準噶爾汗國的前身是蒙古瓦剌部。在之前的土木堡之變中，大明皇帝朱祁鎮的部落就曾經被這個蒙古瓦剌部所俘虜。在朱元璋在位的時候，曾經就派人對北元軍隊繼續展開追擊，而且派出的是徐達、藍玉等優秀的將領，然而即使是這樣這件事也並沒有得到完全的解決。後來還因為考慮到蒙古軍的威脅，朱棣甚至進行了遷都。

　　到了明朝中後期，瓦剌勢力又不太安分了。後來因為一些矛盾的問題，瓦剌被分成了幾個部落，準噶爾就是其中的一個。十七世紀初，也就是明朝衰落的時候，準噶爾也迅速擴張，當時自顧不暇的明朝也沒精力去管這些事情。

　　後來準噶爾的領土迅速擴張到了將近五百萬平方公里，而且連沙俄都不是它的對手，那時候清朝還沒有建立。順治初年，準噶爾成為了附屬國。然而自古以來，宗主國與附屬國都很難維持始終穩定的關係。

　　不過在之後的差不多三十年中，準噶爾汗國還是挺本分的。可是這份老實一直持續到噶爾丹掌權後就破滅了。噶爾丹一直野心勃勃、蠢蠢欲動，還多次對漠南和漠北展開進攻，這種明目張膽的行為簡直是不把清朝放在眼裡。於是便有了康熙率軍親征。古代雖然沒有便利的交通，給勞師遠征帶來了不少的麻煩，但是康熙卻非常的堅定，準備工作做得非常的充足，再加上本來就有人數和火炮上的優勢，於是取得了非常好的戰績。噶爾丹戰敗後也自殺在了逃亡的途中。不過準噶爾還是一直存在的。

　　雍正也與準噶爾交手過，不過並沒有滅掉準噶爾，於是這個任務便交給了乾隆。公元1755年的時候，阿睦爾撒納是準噶爾將領，由於他與國王鬧掰歸降於清朝，乾隆便抓住良機，一舉滅掉了準噶爾，結束了這場70年之久的較量。