漆黑的Wraith神獸捕捉地點一覽：
1，急凍鳥：113號道路寒冰小徑右上角，需要勁力
2，閃電鳥：流星瀑布最深處，綠寶石原版拿TM02（龍爪）的地方
3，火焰鳥：冠軍之路2層的右上角
4，超夢：二週目，石之洞窟推石進入的洞裡，與NPC對話選否獲得破壞基因，之後去120號道路沉寂之窟
5，夢幻：對戰開拓區獲得全部7個金象徽後與亞希達對話獲得古老的海圖，之後坐船去世界邊緣
6，雷公：新紫堇入口右拐
7，炎帝：112號道路熱焰小徑左上角，需要怪力術
8，水君：彩幽市瀑布洞
9，洛奇亞：抓完關東三聖鳥後，去116道路的瀑布上的右邊洞穴
10，鳳王：抓完城都三神獸後，去116道路的瀑布上的左邊洞穴
11，雪拉比：三週目，橙華森林湖中心的森林
12，雷吉洛克：啟用海底遺蹟後111號道路沙漠最南端的沙漠遺蹟
13，雷吉艾斯：啟用海底遺蹟後105號水路西北方的小島橫穴
14，雷吉斯奇魯：啟用海底遺蹟後120號道路的古代墳墓
15，蓋歐卡：同原版，二週目，詢問天氣研究所2樓的博士
16，固拉多：同原版，二週目，詢問天氣研究所2樓的博士
17，裂空坐：同原版，裂空坐平息固拉多、蓋歐卡戰鬥的劇情結束後，天空之柱頂樓
18，拉帝亞斯、拉帝歐斯：二週目開始跟媽媽對話，選擇的那個全地圖隨機遇（5.0版本在124號水道碎片屋左下方的小潛水點下去，然後再潛，再上浮，在潛，再上浮，到達目的地面板顯示在126號水道，海面上碰到的第一隻怪100%遇到）；在水靜市燈塔附近的水手處得到船票，之後坐船去南方小島可捕捉沒選的那個
19，基拉祈：對戰開拓區獲得全部7個銀象徽後與亞希達對話獲得許願星，之後去綠嶺市，調查一塊白色岩石
20，代歐奇希斯：擊敗坂木、交還4塊隕石後，去綠嶺市宇航中心2樓的博士處得到船票，之後坐船去誕生島
21，雷吉奇卡斯：抓完雷吉洛克，雷吉艾斯，雷吉斯奇魯後的海底遺蹟
22，迪奧魯加：三週目，寐龍鎮源初之山頂部的靜止之刻
23，帕魯基亞：二週目，寐龍鎮源初之山頂部的斷空瀑布
24，基拉帝納：二週目，抓到超夢後到送神火山塔內頂樓，調查白色墓碑到達反轉世界，戰勝惡系道館並捕捉/打敗蓋諾塞克特後在反轉世界盡頭遇到（未戰勝惡系道館之前無法抵達基拉帝納所在區域）
25，克雷色利亞：三週目，夢源鎮右下角房子睡覺
26，達克萊伊：三週目，月魘鎮左上角房子睡覺
27，瑪納霏：三週目流逝之海某處潛水，到深海之殿
28，潔咪：捕獲基拉帝納後的輪迴鎮一青年處獲得冥界之花，再與綠蔭鎮右下角一女子對話獲得感恩之花，最後去二週目繽紛之路的北面的花之海
29，阿爾宙斯：捕獲迪亞魯卡，帕魯奇亞和基拉帝納，Wraith摩天樓全部地區通過後擊敗艾沃利30，獲得天界之笛，去源初之山頂部創世神殿（身上不得帶大師球）
31，比克提尼：三週目，紅蓮之窟最深處
32，雷希拉姆：三週目，去沉默地下街調查神秘文字後，幻龍之塔左邊的現實之間
33，捷克羅姆：三週目，去沉默地下街調查神秘文字後，幻龍之塔右邊的理想之間
34，黑色酋雷姆：三週目，抓完烈希拉姆和捷克羅姆並與阿庫羅馬交談後，永凍之窟深處的調和之間
35，白色酋雷姆：三週目，抓完烈希拉姆和捷克羅姆並與阿庫羅馬交談後，淺灘洞穴深處的調和之間
36，凱路迪歐：三週目諒解之路右邊的清澈溪流頂部
37，蓋諾賽克特：反轉世界斷罪之間，需打敗前火箭隊研究員
漆黑的Wraith神獸捕捉地點一覽：
1，急凍鳥：113號道路寒冰小徑右上角，需要勁力
2，閃電鳥：流星瀑布最深處，綠寶石原版拿TM02（龍爪）的地方
3，火焰鳥：冠軍之路2層的右上角
4，超夢：二週目，石之洞窟推石進入的洞裡，與NPC對話選否獲得破壞基因，之後去120號道路沉寂之窟
5，夢幻：對戰開拓區獲得全部7個金象徽後與亞希達對話獲得古老的海圖，之後坐船去世界邊緣
6，雷公：新紫堇入口右拐
7，炎帝：112號道路熱焰小徑左上角，需要怪力術
8，水君：彩幽市瀑布洞
9，洛奇亞：抓完關東三聖鳥後，去116道路的瀑布上的右邊洞穴
10，鳳王：抓完城都三神獸後，去116道路的瀑布上的左邊洞穴
11，雪拉比：三週目，橙華森林湖中心的森林
12，雷吉洛克：啟用海底遺蹟後111號道路沙漠最南端的沙漠遺蹟
13，雷吉艾斯：啟用海底遺蹟後105號水路西北方的小島橫穴
14，雷吉斯奇魯：啟用海底遺蹟後120號道路的古代墳墓
15，蓋歐卡：同原版，二週目，詢問天氣研究所2樓的博士
16，固拉多：同原版，二週目，詢問天氣研究所2樓的博士
17，裂空坐：同原版，裂空坐平息固拉多、蓋歐卡戰鬥的劇情結束後，天空之柱頂樓
18，拉帝亞斯、拉帝歐斯：二週目開始跟媽媽對話，選擇的那個全地圖隨機遇（5.0版本在124號水道碎片屋左下方的小潛水點下去，然後再潛，再上浮，在潛，再上浮，到達目的地面板顯示在126號水道，海面上碰到的第一隻怪100%遇到）；在水靜市燈塔附近的水手處得到船票，之後坐船去南方小島可捕捉沒選的那個
19，基拉祈：對戰開拓區獲得全部7個銀象徽後與亞希達對話獲得許願星，之後去綠嶺市，調查一塊白色岩石
20，代歐奇希斯：擊敗坂木、交還4塊隕石後，去綠嶺市宇航中心2樓的博士處得到船票，之後坐船去誕生島
21，雷吉奇卡斯：抓完雷吉洛克，雷吉艾斯，雷吉斯奇魯後的海底遺蹟
22，迪奧魯加：三週目，寐龍鎮源初之山頂部的靜止之刻
23，帕魯基亞：二週目，寐龍鎮源初之山頂部的斷空瀑布
24，基拉帝納：二週目，抓到超夢後到送神火山塔內頂樓，調查白色墓碑到達反轉世界，戰勝惡系道館並捕捉/打敗蓋諾塞克特後在反轉世界盡頭遇到（未戰勝惡系道館之前無法抵達基拉帝納所在區域）
25，克雷色利亞：三週目，夢源鎮右下角房子睡覺
26，達克萊伊：三週目，月魘鎮左上角房子睡覺
27，瑪納霏：三週目流逝之海某處潛水，到深海之殿
28，潔咪：捕獲基拉帝納後的輪迴鎮一青年處獲得冥界之花，再與綠蔭鎮右下角一女子對話獲得感恩之花，最後去二週目繽紛之路的北面的花之海
29，阿爾宙斯：捕獲迪亞魯卡，帕魯奇亞和基拉帝納，Wraith摩天樓全部地區通過後擊敗艾沃利30，獲得天界之笛，去源初之山頂部創世神殿（身上不得帶大師球）
31，比克提尼：三週目，紅蓮之窟最深處
32，雷希拉姆：三週目，去沉默地下街調查神秘文字後，幻龍之塔左邊的現實之間
33，捷克羅姆：三週目，去沉默地下街調查神秘文字後，幻龍之塔右邊的理想之間
34，黑色酋雷姆：三週目，抓完烈希拉姆和捷克羅姆並與阿庫羅馬交談後，永凍之窟深處的調和之間
35，白色酋雷姆：三週目，抓完烈希拉姆和捷克羅姆並與阿庫羅馬交談後，淺灘洞穴深處的調和之間
36，凱路迪歐：三週目諒解之路右邊的清澈溪流頂部
37，蓋諾賽克特：反轉世界斷罪之間，需打敗前火箭隊研究員