700 逼近灰原秘密的黑影（後篇） 701 漆黑的特快列車（發車） 702 漆黑的特快列車（隧道） 703 漆黑的特快列車（交叉） 704 漆黑的特快列車（終點） 705 密室中的柯南 706 解謎的波本 722 香甜冰涼的快遞（前篇） 723 香甜冰涼的快遞（後篇） 734 茱蒂的追憶與賞花的陷阱 739 小五郎在酒吧裡（後篇） 740 小蘭也倒在浴室裡了（前篇） 770 氣氛僵硬的茶會（前篇） 771 氣氛僵硬的茶會（後篇） 還有就是最近的緋色篇了

699 逼近灰原秘密的黑影 （上）

700 逼近灰原秘密的黑影 （下）

701 漆黑的神秘列車（發車）

702 漆黑的神秘列車（隧道）

703 漆黑的神秘列車（交叉）

704 漆黑的神秘列車（終點）

734 茱蒂的追憶與賞花的陷阱（1小時特別版）

779 緋色的序章

780 緋色的追尋

781 緋色的交叉

782 緋色的迴歸

783 緋色的真相

以下不確定是不是主線劇情

705 密室中的柯南 【黑色組織】

706 揭開謎底的波本 【黑色組織】

739 小五郎在酒吧裡（上）【黑色組織】

740 倒在浴室裡的小蘭（下）【黑色組織】

770 氣氛僵硬的茶會（上）【黑色組織】

771 氣氛僵硬的茶會（下）【黑色組織】

810 縣警的黑暗（上）【黑色組織】

811 縣警的黑暗（中）【黑色組織】

812 縣警的黑暗（下）【黑色組織】

813 悄悄靠近安室的黑影【黑色組織】

2016劇場版：純黑的噩夢

大概就是這樣，應該沒有遺漏了~