硝化細菌屬於自養型細菌。

自養型生物：以大氣中的二氧化碳或環境中的碳酸鹽為碳素營養的一種營養型別。

比如，綠色植物和少數細菌為自養型，它們能將簡單的無機物二氧化碳或碳酸鹽合成複雜的有機物，供生命活動的需要。

自養型生物可分為：光能自養型和化能自養型。

光能自養型生物：細胞內含有光合色素，可將日光能轉變為化學能，供給生命活動需要。

化能自養型生物：透過氧化某些無機物獲得能量，例如硝化細菌氧化氨(NH3)；硫化細菌氧化硫(S)或硫化氫(H2S)獲得能量。

異養型生物：不能透過自身將無機物合成有機物，只能透過攝取有機物維持新陳代謝。

自養型生物與異養型生物的根本區別是： 能否透過自身將無機物合成為有機物。

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硝化使用

市售硝化細菌製劑可分為活菌及休眠菌兩種，漁友可依自己的需要選購使用。前者是利用細菌的活體制成，在顯微鏡的觀察下，可看到它們的活動情形。後者是利用休眠菌製成，在顯微鏡的觀察中，則無法看到它們具有活動能力。

選擇活菌的好處是除氨效果迅速，最適用於氨濃度過高的緊急情況。

但是因活菌對氧氣的要求十分嚴格，尤其是硝酸菌屬的細菌只能在有充份氧氣存在下才能生存，正因為如此，要將活菌儲存並製成產品，常有儲存上的困難，所以在購買這類產品時，要特別注意它的有效使用期限，如果使用過期產品，就除氨的觀點而言，是沒有什麼效率的。

擇休眠菌的優點是能耐久藏，較不用擔心失效的問題，但是因為由休眠菌變成活菌所需的活化時間可能需要數天之久，所以無法使用於緊急狀況之處理，僅適用於日常的水質管理。

一般言之，休眠菌的儲存期限約為1 ~ 2 年，使用時仍需注意商品所標明的使用期限，以免過期失效。另外，此種產品僅亞硝酸菌屬之細菌能被製成製劑，故使用後可能會有多餘的中間物 no2- 滯留累積於水中，使亞硝酸的濃度有暫時性突然提高的現象，惟對水質不會有明顯之影響。