矽化木的價值在於它的天然性，這也是其最重要的特色和屬性之一，自然形成的紋理、色彩、造型，使得每一件矽化木都是獨一無二的。對於矽化木的清洗和保養方法，常見的養石方法有以下幾種。
第一種：水養
水養這種方法最常見、最簡單易行，對於大部分奇石都很適用，特別是矽化木原石在採集、運輸過程中，難免會對樹皮、石肌造成一定程度的損傷。這種情況下，可以先將矽化木置於露天的水泥石架上，定期澆水，並讓其經受日曬雨淋，使之在質感、色感等方面達到調和。 矽化木可以一兩天澆一次水，使其表面保持潤澤；也可以用半溼的布擦拭，使其保持整潔。
第二種：手養 手養這種方法適用於小件矽化木。經常用手把玩、撫摩，石頭吸收人體毛孔排出的油脂，天長日久，石體會發出成熟的光澤，經常把玩的石頭就會變成熟石，這種光潤可人的石表現象，行話為包漿，包漿越凝重越好，既體現了收藏者對矽化木的愛護，也為矽化木的自身增色、增值。
第三種：蠟養 蠟養上蠟既能使紋理圖案清晰，又能使石頭更加溫潤，強化矽化木的天然之美。蠟養的矽化木要求硬度較高，硬度較低的矽化木表面粗糙，吸蠟後顏色易變得黯沉。 上蠟適宜在夏季高溫的情況下進行，先將矽化木表面清洗乾淨，然後用一塊固體石蠟往石表上塗蠟，此時石頭的溫度要能使石蠟熔化，溫度宜高不宜低。隨著石頭的冷卻，熔化的石蠟也凝固在石表之上。上蠟的量要以蠟液能全部被石表吸收為準。
第四種：鋼刷 新採集到的矽化木，受自然環境的作用，一般表面會有許多附著物如汙垢、伴生物等。為了更好的體現矽化木在形、質、色、紋、意等外觀上的特點，需要進行簡單的人工處理，將原石表面的附著物除掉。由於附著物一般有一定的硬度，故有石友使用鋼刷對附著物進行清除。使用鋼刷時一定要有耐心，邊刷邊看，適可而止，注意不要破壞石相，影響矽化木的觀賞效果。只要使用得當，一般不會損害原始的表面，不露人工痕跡的。有些原石的附著物硬度較大，且分佈面廣，而且與原石在物質成分上根本不同，可以考慮用化學反應來清除附著物，如用鹽酸浸泡清洗。使用化學反應清除附著物時，因受條件限制不能準確的判斷原石和附著物的成分，可以採用先同類原石試用、再由調節鹽酸濃度稀到濃、浸泡時間由短到長的方法摸索進行，以免造成原石的破壞性損傷。
矽化木的價值在於它的天然性，這也是其最重要的特色和屬性之一，自然形成的紋理、色彩、造型，使得每一件矽化木都是獨一無二的。對於矽化木的清洗和保養方法，常見的養石方法有以下幾種。
第一種：水養
水養這種方法最常見、最簡單易行，對於大部分奇石都很適用，特別是矽化木原石在採集、運輸過程中，難免會對樹皮、石肌造成一定程度的損傷。這種情況下，可以先將矽化木置於露天的水泥石架上，定期澆水，並讓其經受日曬雨淋，使之在質感、色感等方面達到調和。 矽化木可以一兩天澆一次水，使其表面保持潤澤；也可以用半溼的布擦拭，使其保持整潔。
第二種：手養 手養這種方法適用於小件矽化木。經常用手把玩、撫摩，石頭吸收人體毛孔排出的油脂，天長日久，石體會發出成熟的光澤，經常把玩的石頭就會變成熟石，這種光潤可人的石表現象，行話為包漿，包漿越凝重越好，既體現了收藏者對矽化木的愛護，也為矽化木的自身增色、增值。
第三種：蠟養 蠟養上蠟既能使紋理圖案清晰，又能使石頭更加溫潤，強化矽化木的天然之美。蠟養的矽化木要求硬度較高，硬度較低的矽化木表面粗糙，吸蠟後顏色易變得黯沉。 上蠟適宜在夏季高溫的情況下進行，先將矽化木表面清洗乾淨，然後用一塊固體石蠟往石表上塗蠟，此時石頭的溫度要能使石蠟熔化，溫度宜高不宜低。隨著石頭的冷卻，熔化的石蠟也凝固在石表之上。上蠟的量要以蠟液能全部被石表吸收為準。
第四種：鋼刷 新採集到的矽化木，受自然環境的作用，一般表面會有許多附著物如汙垢、伴生物等。為了更好的體現矽化木在形、質、色、紋、意等外觀上的特點，需要進行簡單的人工處理，將原石表面的附著物除掉。由於附著物一般有一定的硬度，故有石友使用鋼刷對附著物進行清除。使用鋼刷時一定要有耐心，邊刷邊看，適可而止，注意不要破壞石相，影響矽化木的觀賞效果。只要使用得當，一般不會損害原始的表面，不露人工痕跡的。有些原石的附著物硬度較大，且分佈面廣，而且與原石在物質成分上根本不同，可以考慮用化學反應來清除附著物，如用鹽酸浸泡清洗。使用化學反應清除附著物時，因受條件限制不能準確的判斷原石和附著物的成分，可以採用先同類原石試用、再由調節鹽酸濃度稀到濃、浸泡時間由短到長的方法摸索進行，以免造成原石的破壞性損傷。