彈頭再入時的黑障階段意味著彈頭被“離子鞘”包裹，無法發射和接受電波，這一階段往往採用慣性制導。

慣性制導是利用陀螺儀和加速度表組成的慣性測量裝置測量導彈的運動引數，控制其按預定路線飛行的一種制導方式。與制導程式要求的預定值進行比較，如果有誤差，制導系統即發出指令，修正導彈的彈道直至命中目標。慣性制導系統由慣性測量裝置、計算機和執行機構等組成。慣性測量裝置測出導彈運動引數的變化，計算機根據實時測得的資料、發射前輸入的初始條件和重力影響等資料，算出導彈的實際飛行速度、航向、姿態和座標，並將這些資料與制導程式要求的預定值進行比較，根據偏差大小產生相應的制導指令，執行機構根據制導指令控制導彈沿正確的路線飛行。

慣性制導技術是一種完全自主式的制導技術,具有自主性強、隱蔽性好、機動、連續、實時和不受氣候條件限制等優點,因而在現代武器中應用廣泛。慣性制導技術是制導系統的基礎。國外先進國家均非常重視慣性技術的研究,如美國一直致力於慣性器件、數字、導航與載體控制技術等慣性技術的研究發展。

由於慣性制導會積累誤差,射程越遠,飛行時間越長,誤差增加也越大，所以目前彈道導彈大都採用多種制導方式結合的辦法，並在飛行過程中相互修正。由於黑障階段時間不長，靠慣性制導基本不會有過大的誤差，在跨過黑障以後，一些導彈會立刻用其他制導手段予以修正，保證彈頭的精確性。