這是兩個問題，我分開來回答！

1.藥物的作用肯定是大於副作用的！！！這點毋容置疑，藥之所以能成為藥，就是因為其治病或者能預防、診斷疾病，這些就是藥的作用。治療作用以外的其他作用都成為副作用，所以有“是藥三分毒”的論斷，關於這一問題，我曾做過解釋！

如果一個藥物的副作用大於治療作用，那為什麼還要選擇這個藥物呢？如果是自己選的，那就是沒事找事，搬起石頭砸自己的腳！！！如果是醫生選的，我懷疑這是個庸醫！！！藥物千千萬，治病為何非要這個藥不可？

2.第二個問題，如果是學過藥學的人都知道，R/S構型。我簡單地解釋一下，藥物的化學式是確定的，一個化學式可以有成千上百種結構式，但是要記住，一個藥物只對應一種絕對構型，即一種藥物只有一個確定的空間結構！！！對於有手性的藥物，大多還必須區分手性，否則就會出現“反應停”事件，這是非常可怕的！！！

所以，不用擔心藥物的化學結構帶來的毒性，因為藥物的結構是確定的，一種藥物只有一種化學空間結構（包括手性），除非是臨床試驗證明手性對藥理、毒理沒有影響，才不需要區分手性化合物，這是都是藥物上市前臨床試驗需要做的一部分！！！

以一種藥為例說明：

抗生素——阿莫西林

結構如下：

結構中的虛實線就代表化學鍵的方向，空間中的結構，這些都是固定不能變的，在藥品說明書中也會有！

再看看命名，就更清楚了！

（2s，5r，6r）-3，3-二甲基-6-【（r）-（-）-2-氨基-2-（4羥基苯基）乙醯氨基】-7-氧代-4-硫雜-1-氮雜-1-氮雜雙環【3.2.0】庚烷-2-甲酸

其中，2s、5r、6r就是對阿莫西林空間結構的化學鍵朝向的描述，也就是上面提到的手性問題！

所以，一個藥物是不會因為其化學結構問題而出現毒性的！！！這是藥物上市前必須解決的問題！！！

如題。如果一個化合物成為了藥，我個人的意見是：其作用大於副作用的。如果一個化合物尚未討論起使用時的作用，其副作用大於了作用，應該是不會將其作為一種藥物來使用的。但是如果說一個化合物已經成為了一種藥了，討論起作用和副作用，就有很多的意義了，所以有這麼一種說法“利大於弊”時用，“弊大於利”時不用，“利弊相當”就得好好掂量一下了。

題主能有這種考慮，說明有一定的化學的基礎，考慮問題還算深入，但是不夠全面。藥物的副作用，如果是由同分異構體導致的，那藥廠的人員會想方設法的分離它們，提純它們，只有這樣才能安全正常的使用；當然也有藥物確實是同分異構體的混合物，但是前提為提純難度太大，而副作用方面沒有差別。

下面是重點，請拿出本子來記下來：藥物的副作用，簡單說來就是：非治療作用的藥物作用都屬於副作用。那請回答副作用都是不好的嗎？當然不是啦，作用都是多方面的，甚至都不是“黑白灰”三色的劃分，而是五光十色的~其中一個原因是由人體內的受體決定的：人體那麼負責，受體那麼多，一種藥物進入體內，與治療相關的受體結合就發揮了治療作用，剩下的就是副作用了。例如，很常見的一個藥物-二甲雙胍，是一種降糖藥物，二型糖尿病的患者基本都要使用一段時間，它的作用就是降糖，藥理作用有很多種，包括：延緩葡萄糖由胃腸道的攝取，透過提高胰島素的敏感性而增加外周葡萄糖的利用，以及抑制肝、腎過度的糖原異生，不降低非糖尿病患者的血糖水平。而它有一個副作用是能導致乳酸酸中毒（尤其腎功能不全時），但是它還有副作用是降低體重（一段時間內），所以還可以當減肥藥呢。

“是藥三分毒”這種說法是沒問題的，任何事情都要辯證的看，也是沒問題的。任何事情都要講求一個“度”，俗話說“萬惡淫為首”，這裡的“淫”就是過度的意思。藥物的使用是一門科學，需要在醫生藥師的指導下合理的使用，可以最大限度的發揮其“利”的部分，規避“弊”的部分。相信科學，相信藝術（我始終認為藥物的使用是一種藝術），祝大家身體健康，遠離疾病。