寶可夢的種類數不勝數，但是依然有少部分寶可夢發生了基因突變。有的巨大化，有的突變出種族裡所沒有的異能，而它們的實力更是比常態寶可夢強大數倍！甚至能夠與遠古神獸一戰！

第一個，巨大快龍。

這隻快龍當時可以說是童年心理陰影了，因為根本沒想到還有這麼大的寶可夢！小智在他面前顯得這麼渺小，怕不是有百米以上的高度，在寶可夢世界當中應該是絕對不可能存在的。而且這個彩蛋出現的時候快龍還沒有登場！這個伏筆至今還沒有回收！

第二個，巨大耿鬼。

在超古代遺蹟發現的巨大耿鬼，在這裡小智發現了上古時期寶可夢的化石，小霞非常畏懼，建議小智不要將東西帶出遺蹟，結果小智不信，導致巨大耿鬼出現。體型比一般耿鬼大了不止十倍，非常難以對付。

第三個，巨大胡地。

（假裝是胡地）

同樣是在超古代遺蹟出現的寶可夢，似乎和巨大耿鬼是敵人，兩個寶可夢上演了世紀大戰，胡地本身就是一個看起來比較衰老的英雄，巨大胡地好像是從上古來的，已經在地下沉睡了不知多少年。最後兩個巨大寶可夢還是靠遺蹟中出現的巨大胖丁使用催眠曲制服！

第四個，水晶大巖蛇。

整個寶可夢世界中最珍稀的品種之一，完全顛覆了大家對於大巖蛇的認識，甚至唯一的弱點水也不怕了，缺開始害怕火了！這個寶可夢是小剛的夢想，但是後來小剛想明白了，美麗的水晶大巖蛇屬於自然而不是某個訓練師！

第五個，會說話的喵喵。

火箭隊的喵喵是全世界唯一一個會說話的喵喵，因為本來喵喵絕不可能說人話，只會說喵喵。這也是喵喵這個種族的名稱來歷！所以說喵喵也是天賦異稟！