《寂靜嶺3》是由Konami開發的一款動作冒險遊戲，於2003年11月7日發行。該遊戲是《寂靜嶺》系列的第三部作品。在這次的故事中，是以一名平凡的少女Heather為遊戲主角。Heather原本只是一名普通的少女，每天都過著穩定平和的生活。但有一次當她前往商場買東西時，商場裡卻突然出現了無數恐怖的異形怪物，使商場頓時成為恐怖的人間煉獄。為了逃出這個充滿危機的恐怖世界，Heather必須拿著手槍、穿梭在表裡兩個不同世界中為求生而奮戰。

首先要說，2代是獨立劇情，3和它沒關係，3代是延續了1代的劇情。 寂靜嶺不像其他遊戲那樣，每出一代就得和上一代有關，寂靜嶺是跳躍式的劇情 .

達裡婭（Dhalia）的“召神”儀式被哈里(Harry)破壞後，哈里帶著艾麗莎（Alessa）臨死前留下的轉身聖女逃離了寂靜嶺，並給這個聖女起名為海瑟（Heather）。教會因為達裡婭之死，由克勞蒂婭（Claudia）繼位，成為新的教會領袖，她是艾麗莎年幼時候的好朋友，同時也是最虔誠的教徒，對神的信奉已經達到了令人髮指的地步。為了找回聖女而派教眾四處追殺哈里，哈里帶著海瑟不斷的在各個城市之間遊走。老偵探道格拉斯（Douglas）的調查報告中提到，海瑟12歲的時候，哈里曾經殺死一個人，但被判正當防衛而無罪釋放，然後父女兩人立刻離開當地。從這個報告中可以看出，父女倆一直為躲避教會的追殺而居無定所。故事也就從這裡開始了。

海瑟17歲的時候，與父親暫時定居在這個城市中。但克勞蒂婭竟然僱傭了一名私家偵探道格拉斯來找尋他們的蹤跡，而經驗豐富的道格拉斯很快的就在這個城市找到了他們的居住地。在其勸說海瑟跟他一起去見克勞蒂婭的同時，教會的殺手已經闖進哈里家中將其殺害。回到家的海瑟，見到父親的屍體，心中的痛苦完全被仇恨所覆蓋，她發誓要殺了克勞蒂婭為父親報仇，而老偵探道格拉斯也知道自己被利用了，深感內疚的他決定陪同海瑟一起去寂靜嶺。說到這裡就不得不提一下重要資料“哈里的日記”，裡面可以瞭解到這個故事發生的大概時間和一些線索，其中哈里提到自己曾經猶豫過，海瑟的出現讓他痛失了自己的愛女謝瑞爾，痛苦的他試圖用雙手掐死她，但最終善良的哈里還是把海瑟當親生女兒一樣撫養長大，並且深愛著她，為了不傷害海瑟，哈里一直隱瞞著她的身世。知道了所有事情的真相，坐在車上的海瑟傷心的留下了眼淚，“我還沒機會告訴你，你讓我有多幸福”海瑟說出了自己一直想對父親說的話，父親也再沒有機會聽到的話，而這句話也將整個遊戲傷感氣氛烘托到了極點。

在此期間，海瑟還遇到了教會的“智囊”文森特（Vincent），在他的出謀劃策下，教會日益壯大，有了自己的教堂和隸屬於教會的慈善機構孤兒院（Silent hill Smile Support Society簡稱4S）。他是教會的功臣，但與克勞蒂婭的觀點相反，他非常崇尚拜金主義，雖然也非常信奉神的存在，但主要是藉助教會之名收斂錢財，他認為神降臨後建立了天堂，就不能滿足他的金錢慾望了，所以千方百計的破壞儀式的舉行。還利用海瑟去醫院找克勞蒂婭那個已經變成怪物的父親雷納德（Leonard），如果海瑟死了就可以直接破壞儀式，如果雷納德死了，就可以獲得The Seal Of Metatron，利用這個封印去和克勞蒂婭對抗（1代的艾麗莎就是用它與母親達裡婭抗衡的）。隨著海瑟在寂靜嶺四處找尋克勞蒂婭蹤影，她還得知了克勞蒂婭另一個可怕的陰謀。克勞蒂婭殺了哈里，是為了使海瑟心中充滿殺父仇恨，並且製造幻象使海瑟眼中把大量的教徒看成怪物，從而在不斷的廝殺中激發海瑟內心的殺戮感，使海瑟體內的“神”得到良好的生長環境。克勞蒂婭認為，在血腥和仇恨中誕生的“神”絕對是最強大最完美的。瞭解克勞蒂婭陰謀的海瑟最終在教堂遇到了這個“虔誠”的教徒，文森特的如意算盤並沒有奏效，封印沒能夠阻止儀式，克勞蒂婭也一刀解決了這個教會的叛徒。海瑟突然想起了父親留給她的項鍊裡的一顆紅色藥丸Aglaophotis-----1代最終逼出怪物的驅魔聖物，吃下它的海瑟吐出了一個蠕蟲狀的怪物-----所謂中“神”的本體，海瑟正想一腳踩死它，瘋狂的克勞蒂婭將其吞食到自己的體內，但由於她不是真正的Mother of God的母體，所以變成了一個畸形的怪物，很快就被海瑟消滅了。