1、定義不同

細胞：細胞 （英文名：cell）並沒有統一的定義，比較普遍的提法是：細胞是生物體基本的結構和功能單位。已知除病毒之外的所有生物均由細胞所組成，但病毒生命活動也必須在細胞中才能體現。

微生物：個體難以用肉眼觀察的一切微小生物之統稱。微生物包括細菌、病毒、真菌和少數藻類等。

病毒是一類由核酸和蛋白質等少數幾種成分組成的“非細胞生物”，但是它的生存必須依賴於活細胞。根據存在的不同環境分為空間微生物、海洋微生物等，按照細胞結構分類分為原核微生物和真核微生物。

2、特徵不同

細胞：所有的細胞表面均有由磷脂雙分子層與鑲嵌蛋白質及糖被構成的生物膜（注意 ：癌細胞無糖被，容易遊走擴散），即細胞膜。

所有的細胞都含有兩種核酸：即DNA與RNA。

作為遺傳資訊複製與轉錄的載體。

作為蛋白質合成的機器─核糖體，毫無例外地存在於一切細胞內。核糖體，是蛋白質合成的必須機器，在細胞遺傳資訊流的傳遞中起著必不可少的作用。

基本上所有細胞的增殖都以一分為二的方式進行分裂。（少數不是，如藍藻的有些種類從老細胞內產生新細胞）

部分細胞能進行自我增殖和遺傳（高度分化的細胞無法自我增殖。）

新陳代謝。

細胞都具有運動性，包括細胞自身的運動和細胞內部的物質運動。