大蒜的顏色跟品種有關係，大蒜品種有好多樣。先說一下外皮顏色，有紅皮蒜，紫皮蒜，白皮蒜。一樣的顏色的又分不同的形狀，其中以蒜瓣為例，有蒼山的四六瓣，金鄉的紅皮多瓣蒜，射陽的白皮多瓣蒜，還有摍羊山的大白皮……等等

大蒜有白皮大蒜(簡稱白蒜)和紫皮大蒜(簡稱紅蒜)兩種，這兩者主要是大蒜皮的區別，故名思義白蒜即蒜皮是白色的，紅蒜蒜皮是紫色的，究竟白蒜是不是從紅蒜變異而來，經過人工培育後而衍生成一個新品種的，無從考證。兩者比較，白蒜的產量略低於紅蒜，辛辣味也略遜於紅蒜，但二者品種總體相差不大。至於為什麼有的地方種植的是紅蒜，有的地方種植的是紅蒜，除了個人因素外，也於白蒜比紅蒜抗寒性好一點有關。其實，凡是能栽種紅蒜的地方也能栽種白蒜，同樣的，能栽種白蒜的地方也能栽種紅蒜，從實際生產上看，絕大多數蒜農更熱衷於種植紅蒜，即使種植白蒜的蒜農，白蒜的種植面積只佔總面積的三分之一或二分之一，可見紅蒜是主栽品種。多年的市場交易規律，白蒜的收購價比紅蒜每斤高0.20元左右，如果題主改為"白蒜的售價比紅蒜高，但蒜農為什麼仍多種紅蒜"也許更能引起共鳴(附註：近期白蒜出庫價比紅蒜每斤低0.10元左右)。

植物界分類類按界、門、科、屬、種進行分類。大蒜屬於百合科蔥屬植物種蒜，從植物學分類兩種顏色是一個種。哪為什麼又出現白皮和紫皮了，主要是種子的基因不同從而對色素吸收不同而至。紫皮為早熟品種，不耐寒，一般春夏季種。白皮屬晚熟品種，耐寒，一般秋冬種。不知道這種回答是否滿意。