首先自然是我們這個版本的主角之神-大地之神固拉多，神獸固拉多傳說是大地的創造者，而想要捕捉固拉多在二週目中需要在天氣研究所得到訊息，最終在陸之窟打敗火巖隊赤焰松才有機會捕捉

和固拉多一起出現的自然是海洋之神蓋歐卡，同樣方法也是類似，需要找到天氣研究所提到的天氣異常的地點，然後在這個地點找到海之窟，在海之窟的深處捕捉神獸蓋歐卡

胡帕是頑童寶可夢，在動漫電影中可以說異常強大甚至還出現了固拉多不會飛的梗，而在遊戲中想要捕捉必須到達海底的沉船遺蹟，在遺蹟深處才能找到神獸胡帕、

裂空座：是究極綠寶石的三神獸之一，一半居住在天空之柱上，而想要捕捉必須在二週目中為了完成外太空的任務，前往天空之柱阻止希嘉娜之後才可以捕捉

科斯莫古是星雲寶可夢，同樣也是日神和月神的幼生寶可夢，而想要捕捉這個神獸需要到達流星瀑布深處，完成外太空劇情後才可以捕捉到

代歐奇希斯是外太空的寶可夢，需要阻止龍之使者希嘉娜後，和源治天王一起進入外太空，在外太空的隕石上碰觸到迷宮之後才可以捕捉到

亞克諾姆：意志之神，在二週目中居住在彩幽市附近的心之洞窟中，到達心之洞窟盡心捕捉

艾姆利多：感情之神，和另外兩隻三湖神一樣居住在彩幽市瀑布後方的心之洞窟中

由克希：知識之神同樣居住在彩幽市的心之空洞中，這個地方從彩幽市的東南角瀑布一側進入，三湖神在一個小的場景中，進入後可以一起捕捉三湖神