二者都是被Dicer降解後，用於抑制靶mRNA轉錄、翻譯或者能夠剪下靶mRNA並促進其降解，即轉錄後水平的基因沉默。區別有以下2點：1、結合位點不同。miRNA的結合位點通常位於3`UTR，而siRNA的結合位點不確定。siRNA（21~25鹼基），較少干擾RNA，在利用宿主細胞進行轉錄時，常產生一些dsRNA，或者轉座子轉錄、基因組中反向重複序列轉錄等原因產生dsRNA，然後dsRNA被Dicer降解為siRNA。2、來源不同。siRNA（21~25鹼基），叫小干擾RNA，病毒基因、人工轉入基因、等原因等外源性基因隨機整合到宿主細胞基因組內，利用宿主細胞進行轉錄時，常產生一些dsRNA。或者轉座子轉錄、基因組中反向重複序列轉錄等原因產生dsRNA，然後dsRNA被Dicer降解為siRNA。擴充套件資料：miRNA和其target是不完全互補，一般只有2-8位的鹼基是完全互補的，而siRNA是完全互補的。miRNA由高等真核生物基因組編碼，是自己轉錄出來的序列，通常用於生物自身生長調控。siRNA的作用結果是使mRNA剪下，而miRNA有的是剪下，有的只是結合上去抑制翻譯siRNA是一對一的，一條siRNA只針對一個基因，而miRNA是一對多的，一條可以抑制很多基因。mirna是低等和高等生物都存在的 作用在靶基因的mrna 3’utr區域，透過降解或者抑制翻譯來抑制靶基因表達，一條mirna可以有多個靶基因。sirna主要存在於低等生物，可以作用在靶基因的mrna任何地方，透過降解來抑制表達。一般一條sirna只針對一個靶基因，可以透過人為的設計合成sirna來匯入高等生物細胞中誘發抑制作用。

siRNA是RNAi途徑的主要作用物,miRNA和siRNA很容易混淆，他們有許多共同點也有許多不同點。為了能夠清楚地讓讀者弄清兩者之間的差異之處，筆者特別將它們之間的差別劃分入三個大的階段：起源階段、成熟階段和功能階段（即調節基因表達的作用階段）。在描述兩者的差異之前，有必要先說一說它們的共同點：

1． MiRNA和siRNA都是由22個左右的核苷組成；

2． 它們都是Dicer酶的產物；

3． 它們在起干擾、調節作用時都會和RISC複合體結合；

4． 它們都可以在轉錄後和翻譯水平干擾以抑制靶標基因的翻譯；兩者之間的主要差異：起源階段SiRNA：通常是外源的，如病毒感染和人工插入的dsRNA被剪下後產生外源基因進入細胞（注：病毒入侵，或者是自身合成RNA中出現錯誤，細胞內就會產生雙鏈RNA，來阻止這些異常基因的表達）。MiRNA：是內源性的，是一種非編碼的RNA；由miRNA基因表達出最初的pri-miRNA分子。成熟過程SiRNA：直接來源是長鏈的dsRNA（通常為外源）；經過Dicer酶*切割形成雙鏈siRNA,而且每個前體daRNA能夠被切割成不定數量的siRNA片段。MiRNA：在細胞核中轉錄的較大的pri-miRNA經由Drosha(一種RNAse Ⅲ酶)和Pasha（含有雙鏈RNA結合區域）加工成為單鏈pre-miRNA；接著，髮夾狀、部分互補的pre-miRNA在細胞質中被Dicer*（一種RNAse Ⅲ酶）酶切割形成miRNA；在生物體中的表達具有時序性、保守性和組織特異性。功能階段siRNA：它與RISC*（RNA誘導的沉默複合物，使用的AGO蛋白家族的成分為AGO2）結合，以RNAi途徑行使功能，即透過與序列互補的靶標mRNA完全結合（與編碼區結合），從而降解mRNA以達到抑制蛋白質翻譯的目的；它通常用於沉默外源病毒、轉座子活性。MiRNA:它和RISC形成複合體(利用的AGO蛋白家族成員為AGO1)後與靶標mRNA通常發生不完全結合，並且結合的位點是mRNA的非編碼區的3’端；它不會降解靶標mRNA，而只是阻止mRNA的翻譯； miRNA能夠調節與生長髮育有關的基因。注：RISC, RNA誘導的沉默複合物（RNA-induced silencing complex; RISC）的組裝是在RNAi和miRNA通路中最為複雜的過程。新的研究表明，與siRNA和miRNA結合的RISC複合物並不完全相同其中的AGO蛋白質有AGO1和AGO2之分。剛產生的siRNAs和miRNAs都是雙鏈結構，這種雙鏈結構需要解螺旋才能被組裝到RISC中發揮作用。組裝後的複合物分別稱為siRISC和miRISC。從dsRNA引發RNAi的發生大致劃分為三個階段，即啟動、剪下和擴增。Dicer酶：新的研究表明siRNA成熟需要Dicer-2和R2D2蛋白，而miRNA則依賴Dicer1和它的伴侶loqs蛋白。在研究人員的不懈努力之下，近期miRNA的基礎研究以及應用研究方面取得了許多的重大進展……謝謝！