海水魚缸需要蛋分及過濾器材來維護缸內生物的正常生活，而蛋分的作用也在此過程中顯的尤為重要，那麼蛋分的作用是什麼呢？

我們知道，生物排洩物以及食物殘渣在初期會被水中的腐生細菌分解為有毒物質——氨。而氨的存在是所有魚缸系統中對魚類及珊瑚最大的危害。蛋分的作用就是分解食物殘渣、生物排洩物造成的有機物，其工作原理是利用了泡沫的表面張力來吸附混雜在水中的各種顆粒狀的汙垢以及可溶性的有機物的蛋白質，使其變為黃色的液體被排除，以此來進化水體。這樣，蛋分的作用就體現在有效減少蛋白質在海缸水體中的含量，進一步控制了氨這一有害生物因素的存在。另外還能夠增加水體溶氧量。

蛋分的作用對海水缸中水體的維護很重要，但是蛋分只能去除50% 左右的蛋白質和其它廢物，剩下的部分就需要海水缸過濾系統中產生的硝化細菌來抑制。因此，蛋分建掃了硝化系統的壓力，強大過濾的基礎上，蛋分的作用是很明顯的。

蛋白質分離器分為兩種，一種是吸氣口接在水泵進水孔，此時要將水泵的葉片改造成梳子狀，可以將被吸進去的空氣打成細小的氣泡，而另一種是在水泵出水口開一個洞讓水在流動的時候帶入空氣。但蛋分的作用不會隨這兩種蛋分形式的改變而改變。

另外在日常餵養珊瑚糧的過程中，要將蛋分關掉，原因是蛋分的作用會將珊瑚糧中主要成分蛋白質所分解，不利於珊瑚餵食。