一般來時,起始密碼子最常見的有3-4種,分別是AUG、編碼真核生物中的甲硫氨酸和原核生物中的N-甲醯甲硫氨酸(fMet),GUG(纈氨酸)或AUA(異亮氨酸)、UUG (亮氨酸)等也用作起始密碼子(少數生物中)。
但是生物最大的特點就是沒有絕對的0和1,所有的東西都不是固定的。其實除了以上幾種,其他的密碼子可以作為起始密碼子嗎?答案是肯定的,幾乎所有的密碼子都可以作為起始密碼子,只是不同的密碼子的翻譯起始效率不同,最終反應在蛋白質的產量上的多少而已。
2017年有一個研究組就對所有的密碼子在大腸桿菌中的翻譯起始效率進行了定量分析,最終得到了以下的資料:
從圖中,我們可以看到所有64種起始密碼子的翻譯起始效率的對比,其中效果最佳的前五個密碼子是:AUG>GUG>UUG>CUG>AUA。效果最差的五種密碼子是:CCU<UCC<CAG<UCU<CUU。
所以有時候需要調節蛋白質的表達水平時,除了調節RBS、更換啟動子等元件,可能更加直接的方法是換一個起始密碼子,從圖中可以看出,翻譯起始效率最強的AUG和最差的CCU,差不多有10,000倍的差別,這個變化範圍其實已經很大了。
當然這些只是在大腸桿菌中的資料,僅供參考,在其他生物中可能存在差異。
參考資料:
一般來時,起始密碼子最常見的有3-4種,分別是AUG、編碼真核生物中的甲硫氨酸和原核生物中的N-甲醯甲硫氨酸(fMet),GUG(纈氨酸)或AUA(異亮氨酸)、UUG (亮氨酸)等也用作起始密碼子(少數生物中)。
但是生物最大的特點就是沒有絕對的0和1,所有的東西都不是固定的。其實除了以上幾種,其他的密碼子可以作為起始密碼子嗎?答案是肯定的,幾乎所有的密碼子都可以作為起始密碼子,只是不同的密碼子的翻譯起始效率不同,最終反應在蛋白質的產量上的多少而已。
2017年有一個研究組就對所有的密碼子在大腸桿菌中的翻譯起始效率進行了定量分析,最終得到了以下的資料:
從圖中,我們可以看到所有64種起始密碼子的翻譯起始效率的對比,其中效果最佳的前五個密碼子是:AUG>GUG>UUG>CUG>AUA。效果最差的五種密碼子是:CCU<UCC<CAG<UCU<CUU。
所以有時候需要調節蛋白質的表達水平時,除了調節RBS、更換啟動子等元件,可能更加直接的方法是換一個起始密碼子,從圖中可以看出,翻譯起始效率最強的AUG和最差的CCU,差不多有10,000倍的差別,這個變化範圍其實已經很大了。
當然這些只是在大腸桿菌中的資料,僅供參考,在其他生物中可能存在差異。
參考資料:
Hecht, Ariel, et al. "Measurements of translation initiation from all 64 codons in E. coli."Nucleic acids research45.7 (2017): 3615-3626.