在進行試管嬰兒助孕的夫婦中，由於醫生和患者的嚴密監測和關注，在正常人群中不能覺察到的流產也會及早發現並就醫。因此，試管嬰兒助孕的夫婦發生的流產率看起來要比正常人群會高一些。試管嬰兒流產的幾個原因如下：1、激素水平試管嬰兒胚胎移植雖然是按照自然懷孕胚胎進入子宮的週期進行，高度模仿自然懷孕，但必竟不是自然懷孕。體內的激素水平和正常懷孕不可能做到完全一樣。因此，在成功移植試管嬰兒後後試管嬰兒流產率要略高自然懷孕一點。2、年齡做試管嬰兒的女性大部分年齡偏大，年齡高的女性染色體畸形率高於年輕人，而染色體異常是導致流產的主要因素之一，有資料顯示年齡越高越容易流產。對於同年齡的女性來說，自然懷孕和試管嬰兒的流產率都高於年輕人。3、多胎妊娠併發症試管嬰兒的多胎妊娠率遠遠高於自然懷孕。而多胎妊娠容易導致早產、流產。4、精卵質量不好做第二代試管嬰兒的夫妻為男性精子質量不好，精子質量不好，導致胚胎質量差，因此，容易發生胎停育或者流產。有些女性的卵子質量不好，經過促排卵治療後雖然能取到卵子並人工受孕成功，但依然改變不了卵子質量不好的事實，和精子質量不好一樣容易導致流產。5、不孕不育疾病做試管嬰兒的夫妻大部分患有一些不孕不育疾病的，如子宮肌瘤、子宮內膜異位症、盆腔炎、原發不孕、高齡孕婦等。這些疾病都容易導致孕期早產或流產率高。