武夷山儲存了地球同緯度帶完整典型、面積巨大的中亞熱帶原生性森林生態系統，發育有明顯的植被垂直帶譜：隨海拔遞增，依次分佈著常綠闊葉林帶、針葉闊葉過渡帶、溫性針葉林帶、中山草甸、中山苔蘚矮曲林帶、中山草甸5個植被帶。這樣的森林環境有利於生物多樣性的珍存。武夷山儲存了地球同緯度帶完整典型、面積巨大的中亞熱帶原生性森林生態系統，發育有明顯的植被垂直帶譜：隨海拔遞增，依次分佈著常綠闊葉林帶、針葉闊葉過渡帶、溫性針葉林帶、中山草甸、中山苔蘚矮曲林帶、中山草甸5個植被帶。這樣的森林環境有利於生物多樣性的珍存。 　　2010年春天，我到福建武夷山採訪。剛從機場出來，當地的朋友就把我拉到了市區的一家酒店。這個小鎮一點不像我想象的那樣，卻是一個充斥著旅遊氣息的地方：硬木傢俱、根雕、茶葉幾乎成了武夷山市的商標，這個被稱作“生物的王國”究竟會是怎樣的？ 　　在中國東南部，夏季受到溼潤氣流和季風的影響，能夠帶來充沛的降水。在這個基礎上，夏季的武夷山山脈溫暖多雨，雲霧繚繞，這樣的環境使得這裡孕育了豐富的動植物資源。 　　不僅如此，武夷山一直存在著一個非常奇怪的生物學現象——這裡分佈著很多“本來不應該在這裡生存的物種”。根據“中國動物地理區劃”來看，由於地理上和氣候上的阻隔，沒能讓各個區系的生物在進化上有相似之處，所以不同區系的物種產生了很大的差異，但在武夷山的歷史調查中，地處東洋界，卻發現了古北界的物種。 　　20世紀30年代，美國自然歷史博物館工作人員克利福德·波普（Clifford H. Pope）在中國進行了很長時間的爬行動物研究和標本採集，其中的重中之重就是武夷山山脈。他與同來的相關專家把在這裡發現的大量物種的模式標本標註成“掛墩”。無論從哪個角度來講，掛墩是中國古北界與東洋界最圓滿的交匯區域。 　　武夷山山脈生態學的第二個特點是——棲息在此地的動物種類之多。根據20世紀90年代的科考資料，這裡的哺乳動物佔福建省總量的63%，鳥類是全省總量的52%，爬行類佔63%，兩棲類佔73%。形成這樣的原因，主要是來自於武夷山獨特的地貌——充斥著高聳入雲的山脊和深不見底的山谷，形成了多樣化海拔的複雜環境，這樣可以使很多對環境要求苛刻的小群物種在這裡尋找避難所，躲過了第四紀冰川。這也是在中國近代史上西方生物學研究者在武夷山這片大森林裡如飢似渴地尋找新物種的原因。 　　在武夷山進行生態拍攝，我延續著自己的老習慣，沿公路徒步5公里是尋找拍攝地的最佳位置。即便是在不乏人煙的桐木村邊的公路沿線，只要是沒有皓月當空的暗夜，就能夠找到不少蛇類和蛙類。在抵達保護區的當晚，我們開始徒步尋找。僅1小時，就遇到了5種蛙類和1種蛇類。 　　第二天一早，我們驅車沿著809國道蜿蜒向南，慢慢爬上先鋒嶺，站在瞭望塔上，周圍一片臨海。在先鋒嶺的附近，有兩個最著名的地方：一個是掛墩，另一個就是大竹嵐。最早在學術意義上“發現”了大熊貓和麋鹿的法國傳教士阿爾芒·大衛（Armand David）於1873年進入武夷山採集動物標本。在採集期間，僅僅在掛墩一帶被發現和採集的脊椎動物新種就有62種。這些為了確定新物種的發現，呈現其特徵以進行細分而獲得的標本被認定是“模式標本”。在當地山民的幫助下，當地的很多物種都被製作成了標本，並源源不斷地被送往西方的博物館，極大地豐富了西方世界的動物學知識和標本數量。模式標本的採集者名字被分類學家賦予生物學“二名法”名稱，以表達對採集者的尊重，而採集地點則會作為重要區別資訊留在物種的名字中。因此，1929年由波普發現的掛墩角蟾的二名法名稱就是“Xenophryskuatunensis”。 　　與掛墩同樣著名的是武夷山的大竹嵐，這裡不僅是西方生物學家和傳教士的重要昆蟲標本採集地，也是中國科學家在抗戰期間的重要標本採集地，被稱為“昆蟲的世界”，1941年～1945年，很多著名生物學家在保護區範圍內採集昆蟲樣本，他們中的大多數人曾到訪過大竹嵐，在當地村民的全力幫助下，共採集昆蟲標本60萬號之多。 　　掛墩只是大山裡的一個村莊，彈丸之地，如何能集中那麼多的物種？不免讓人生疑。後人推測，或許為了急於求成，西方的生物學家以重金號召掛墩村民去收集當地的物種，以至於當地村民放棄耕田，導致茶園廢棄。這些村民滿山遍野到處採集，很可能導致採集點並非是出自掛墩，或是在大竹嵐等其他地方。 　　從先鋒嶺上望去，大竹嵐只是遠處山坡上的一片竹海，那裡沒有村莊，沒有人類活動的痕跡，這裡生活著最為稀有的“國蝶”——金斑喙鳳蝶。 　　眼前這片武夷山大竹林並不能與歷史上的情況相提並論。我在掛墩的幾戶人家中熟識了一位傅師傅，他信仰天主教，根據《武夷山志》記載，這一信仰最早於1823年由法國生物學家、傳教士羅公正傳入。他在掛墩建起了一座教堂，在用於宗教活動之外，還成為了當地生物多樣性採集工作站。除此之外，還有不少英華人和美華人在此一邊傳教，一邊做研究和標本採集。傅師傅告訴我，現在的掛墩不比以前了，現在沒有那麼多種青蛙了。 　　我對掛墩人最深刻的印象在於他們的信仰，但剛才提到的那座教堂已毀於一場火災。或許在這裡，能夠感受到某些“國際交流”的餘溫，但我深切知道，這種“國際交流”的由來，與武夷山地區獨特的生物多樣性是密不可分的。

武夷山屬典型的丹霞地貌，是首批國家級重點風景名勝區之一。

武夷山是三教名山。 自秦漢以來，武夷山就為羽流禪家棲息之地，留下了不少宮觀、道院和庵堂故址。武夷山還曾是儒家學者倡道講學之地。

武夷山主要分佈了前震旦系和震旦系的變質岩系，中生代的火山岩、花崗岩和碎屑岩。