（1）直接原因——內部矛盾激化（領導集團之間的矛盾）。定都天京後，太平天國領袖之間的關係越來越遠。洪秀全把精力用於宗教神學的著述，其餘領導結成自己的集團明爭暗鬥。爭權奪利的都正日益尖銳。1856年秋，領導集團內部因爭奪權勢而分裂，先是韋昌輝殺了楊秀清，繼而韋昌輝被處死，接著由於洪秀全的猜忌石達開率領精銳部隊出走。

（2）間接原因——敵人破壞顛覆的影響。太平天國內部成分日益複雜，其中不乏暗藏的敵對分子、見風使舵的投機分子，還有一些人是被迫參加的。這些人在軍隊中挑撥離間、煽動逃亡、叛變，甚至與清軍暗通訊息，給太平天國帶來很大危害。

（3）根本原因——農民自身階級的侷限性。建都天京後，太平天國的領袖們的思想作風發生了變化，沉醉於勝利喜悅中，革命進取心日益減退，開始了對權力和生活的追求，生活上的腐化已相當嚴重。也無法長期保持領導集團的團結，削弱了太平天國的向心力和戰鬥力。

後果：天京事變後，太平天國內人心開始渙散，搞垮了領導核心，削弱了革命力量。加劇了政權的腐敗（鞏固了洪秀全的政治地位，從此不信任何人）。摧折了太平天國的信仰支柱。導致戰局急劇逆轉，清軍陸續在各戰場得勝。天京事變嚴重削弱了太平天國的領導和軍事力量，成為太平天國由盛轉衰的分水嶺。