除魚缸水中產生的氨等有毒物質。1. 硝化菌並不能分解魚排洩物（和其它有益菌組成的硝化系統菌群可以，但很慢）2. 硝化菌並不能分解水中的硫化氫(H2S), 反而會被水中的硫化氫毒害死亡 3. 硝化菌是沒有味道的, 就算死後也只會有微弱的臭味4. 硝化菌無法將氨(NH3)直接氧化為硝酸鹽(NO3)5. 硝化菌只是一個統稱, 其中主要有亞硝酸菌和硝酸菌；亞硝酸菌能將氨(NH3)氧化為亞硝酸鹽(NO2)，而硝酸菌能將亞硝酸鹽氧化為硝酸鹽(NO3)6. 硝化菌要先將氨(NH3)氧化為亞硝酸鹽(NO2)，然後再將為亞硝酸鹽(NO2)氧化為硝酸鹽(NO3)7. 硝化菌的生長需要氧氣8. 二氧化碳不但對硝化菌無害，而且硝化菌需要靠二氧化碳來繁殖和生存 9. 硝化菌是無所不在的10. 硝化菌在魚缸的生長是緩慢的，靠自生方式來建構硝化系統的話，通常需要一個月或以上。如果氨化細菌和硝化細菌對比，氨化細菌要比硝化細菌繁殖快的多，舉例來說，一個氨化細菌繁殖週期評價約為22分鐘，就是22分鐘後1個變2個，然後在翻倍成4個更具科學家評估，在20個小時以後1個細菌可以便成109個。可見氨化細菌繁殖驚人的速度。而硝化細菌就遜色很多。一個硝化細菌中的亞硝酸菌繁殖週期大約是24—36小時，也就是說20小時後硝化細菌還停留在1個細菌的狀態，而硝酸菌繁殖週期更長平均要花掉60個小時才能增值1倍，這也是造成新缸綜合症的主要原因。 11. 硝化菌並不需光照生長，反而有避光生長的現象12. 硝化菌並不能改善水質白濁的問題，而且一丁點的關係都沒有13. 硝化菌非常難儲存，市面所賣的硝化菌絕大多數都是魚目混珠的，大家選購的時候還是儘量選購大品牌的14. 硝化菌在裸缸中所發揮的作用比草缸大，因為大部份水草能代替硝化菌的作用

硝化細菌有個兩個定義：

寬泛的定義—凡是能使土壤或水中的氨氧化為亞硝酸鹽或硝酸鹽的細菌，都可以成為泛硝化細菌。

嚴謹的定義—指以利用氨或亞硝酸鹽作為主要生存能源，以及能利用二氧化碳作為主要碳源的細菌（Watson et al 1989）。

嚴謹定義排除了一些極少數的其他細菌和真菌。我們平時指的硝化細菌是嚴謹定義下的硝化細菌。在農業水產養殖和家庭觀賞魚飼養方面，硝化細菌都是不可或缺的組成部分。

為什麼硝化細菌很重要呢？

以家庭水族箱為例。魚類在生長過程中的排洩物、食物殘渣會很快被細菌分解並釋放出氨（NH3）。氨在水中以氨（NH3）和銨（NH4+）兩種形式出現。而對魚類來說是有很強毒性的，嚴重時會導致魚只死亡。而一部分硝化細菌可以使其與氧（O2）結合，使劇毒的氨（銨）氧化為毒性較輕的亞硝酸鹽（NO2-），硝化細菌由此獲得能量保證自身生存和繁殖。而又有一部分硝化細菌會將亞硝酸鹽轉變為對魚只不具備毒性的硝酸鹽（NO3-）。這個過程在自然界中廣泛存在，而在家庭魚缸中則保證了觀賞魚不會因氨氮中毒，我們稱之為硝化系統。而且強大的硝化系統包含的硝化細菌在生化濾材上安家落戶形成優勢菌種，對抑制魚缸中有害菌的繁殖也有很好的作用！

硝化細菌的分類：

亞硝酸菌（一段菌），將氨氧化為亞硝酸鹽，這群細菌分為5個屬。

硝酸菌（二段菌），將亞硝酸鹽氧化為硝酸鹽，這群細菌分為4個屬。

硝化細菌是地球上的古老菌種，種類繁多，細化到到底有多少種至今未能有準確答案。

魚缸中硝化細菌的培養：

硝化細菌必須要附著在固體物質上才能進行其消化作用，故此在魚缸中需要放置體積小表面積卻非常大的多孔濾材，我們稱之為生化濾材，濾材本身並無特殊過濾效果，但它是硝化細菌的溫床，水流經這些濾材時有毒物質被附著在濾材上的硝化細菌所分解，從而保證了魚只的健康。對於新缸而言，培養硝化細菌病不需要人工新增菌種，因為無論是水中還是空氣中都有硝化細菌存在，只要給硝化細菌提供“食物”，它就會開始在鋁材上繁衍生息。這個過程通常需要約30天。但人工新增硝化細菌有時可以縮短這個時間。

市售的硝化細菌的種類：

市售硝化細菌主要分為液劑和粉劑。液劑中主要儲存的是活菌菌種，比較能發揮立竿見影的效果，但要注意使用年限，因活菌無法長期儲存。粉劑主要是利用急速冷凍乾燥技術製成的產品，這類產品儲存得更久，但菌體活化需要一定的時間。這與氨和亞硝酸鹽的濃度有關。濃度越高則活化時間越短，少則幾天，多則十幾天。

魚缸硝化系統確立的判斷：

通常從新開缸放水後算起，加入闖缸魚、魚便或其他氨元，經常檢測水中的氨和亞硝酸鹽濃度（檢測試劑魚店有售）。兩者會不同步地呈現出逐步增加又逐步降低的過程，當檢測不到兩者在魚缸水中的含量時，我們認為開缸完成，硝化系統已經建立。但入魚時應當注意魚只數量與開缸時氨源數量的對應。避免導致現有硝化平衡無法應付突如其來的大量氨源的情況發生。當笑話系統建立完成，新魚入缸才是安全的。

由於在培養硝化細菌的過程中需要氨源，因此很多魚友會買一些便宜且皮實的魚放入魚缸，俗稱闖缸魚。

培養和維持魚缸中的硝化細菌還要注意一些其他問題：

1、硝化細菌不喜歡管光，因此生化濾材要放在不透光的容器中。

2、硝化細菌不喜歡有機物。即生化濾材之前要有無力過濾，阻擋食物殘渣和魚便等有機物沾染生化濾材。

我是老孫，專注飼養紅龍魚。有問題我們可以共同交流。