ra3接的是ra2盟軍的結局，蘇聯被盟軍的超時空傳送儀戰術擊敗，查丹科和庫可夫使用了測試中的時間機器回到1934年布魯塞爾物理學會議，殺死了超時空傳送儀的研發者愛因斯坦。回到現代以後，蘇聯果然擊敗了盟軍，但是由於沒有核彈的威脅，日本崛起了並且攜帶更加先進的奈米核心科技入侵了亞洲並從海岸線入侵蘇聯。在歐洲戰場，蘇聯一路挺進，盟軍撤退到英國，死守布萊頓海岸（類似二戰時候的敦刻爾克撤退）。盟軍戰役：在成功防守布萊頓海灘以後，盟軍決定解救被蘇聯逮捕的盟軍領導人並摧毀位於戛納的海軍基地。隨後盟軍決定反擊，首先摧毀位於德國海德堡的蘇聯指揮部。隨後由於日本的玄武要塞遏制了北海的海軍行動使得盟軍和蘇聯聯手，先摧毀了位於地中海入海口的直布羅陀基地，隨後炸掉了玄武要塞的能源核心。然而美國總統的反蘇聯情緒使雙方關係出現裂痕，迫於無奈盟軍決定刺殺總統。隨後盟軍和蘇聯約定進攻東京癱瘓東京的指揮部和軍隊系統，但是蘇聯軍隊沒有如約參戰，戰後日本投降。隨後逃往德國的蘇聯科學家澤沃斯基爆料蘇聯在哈瓦那秘密發展軍隊，盟軍前去偵查果然發現了大量的軍隊。在粉碎了哈瓦那的陰謀後盟軍決定對蘇聯發動最後一戰，這時候查丹科和庫可夫準備逃往太空，摧毀了被改造成太空船的列寧格勒堡壘後蘇聯領導被打入冰牢。蘇聯戰役：日本的突襲使蘇聯措手不及，雖然盟軍被擊退但是日本已經深入內地並透過水路襲擊了列寧格勒，失敗後轉投莫斯科，蘇聯動用了K-45衛星挫敗了日本的行動。隨後收回了位於海參崴的海軍軍港。這時美國新總統阿克曼對蘇聯宣戰，蘇聯決定摧毀日內瓦的盟軍總部，隨後佔領了米諾克斯的研究設施，摧毀了歐盟最後的空軍基地剷除了庫可夫將軍（目測是查丹科陷害的）。隨後進攻日本本土，在東京擊敗日本三位指揮官後殺死了天皇。盟軍忌憚蘇聯的實力準備講和，蘇聯設了一個圈套但是被識破，在擊敗盟軍（歐盟方面）主力後查丹科露出真面目準備剷除指揮官，但是被指揮官擊斃。隨後蘇聯進攻紐約，摧毀了美國的主力和自由的象徵：自由女神像，盟軍投降。日本：戰鬥初期，天皇透過摧毀蘇聯的紀念碑雕像來摧毀蘇聯戰士的意志，突襲了沃爾庫塔並摧毀了當地的無畏戰艦戰鬥群，隨後進軍斯大林格勒並佔領運河，在敖德薩組裝了強大的戰爭機器將軍劊子手，夷平了敖德薩。但是天皇的唯心主義嚴重忽略了盟軍的實力，盟軍進攻了珍珠港（遊戲裡是日本軍港），在粉碎進攻後天皇發現盟軍分兵進攻了日本本土——僅僅由玄武要塞守護的東京，摧毀所有盟軍MVC後盟軍利用超時空技術進攻了要塞並開始破壞要塞核心，日本利用天翼飛艇搶回了要塞並依靠要塞的強大設施粉碎了盟軍海軍。隨後天皇繼續文宣攻勢利用浮島要塞進攻了盟軍的聖摩尼卡佔領了那裡的廣播臺。盟軍和蘇聯意識到了帝國的強大決定聯手，澤沃斯基和總統的對話被監聽，天皇得知日本是時間錯誤的產物喪失了對神的天命的信仰，同時交班給太子達郎，此時蘇萌聯軍進攻橫濱並在對岸架設了針對日本奈米科技的通訊隔離設施，在帝國強大的Yuriko Omega的幫助下日本成功擊退了聯軍摧毀了隔離設施。達郎決定徹底摧毀蘇聯，於是進攻莫斯科，同時調動了將軍劊子手，依靠將軍劊子手，日本摧毀了莫斯科和克里姆林宮，蘇聯領導希望轉移時間機器的資料再次使用，但是載著資料的直升機也被擊落了，蘇聯戰敗。隨後日本進攻了位於阿姆斯特丹的盟軍空軍基地和未來科技公司總部，由於盟軍強大的空軍火力，日本的空軍無法使用，在摧毀了空軍基地、癱瘓了質子撞擊炮以後，流亡的蘇聯科學家澤沃斯基攜帶強大的軍隊進入戰場並和未來科技公司達成協議研究超時空傳送儀準備改變戰局。擊敗蘇聯和盟軍的聯軍後，澤沃斯基利用超時空傳送儀送出了數顆毀滅武器夷平阿姆斯特丹，天皇緊急調入自己的直屬精英部隊（全部星級）進入戰場對抗守衛未來科技公司的軍隊，成功摧毀了未來科技公司總部，毀滅了超時空傳送儀的資料，日本完成了稱霸世界的任務。
ra3接的是ra2盟軍的結局，蘇聯被盟軍的超時空傳送儀戰術擊敗，查丹科和庫可夫使用了測試中的時間機器回到1934年布魯塞爾物理學會議，殺死了超時空傳送儀的研發者愛因斯坦。回到現代以後，蘇聯果然擊敗了盟軍，但是由於沒有核彈的威脅，日本崛起了並且攜帶更加先進的奈米核心科技入侵了亞洲並從海岸線入侵蘇聯。在歐洲戰場，蘇聯一路挺進，盟軍撤退到英國，死守布萊頓海岸（類似二戰時候的敦刻爾克撤退）。盟軍戰役：在成功防守布萊頓海灘以後，盟軍決定解救被蘇聯逮捕的盟軍領導人並摧毀位於戛納的海軍基地。隨後盟軍決定反擊，首先摧毀位於德國海德堡的蘇聯指揮部。隨後由於日本的玄武要塞遏制了北海的海軍行動使得盟軍和蘇聯聯手，先摧毀了位於地中海入海口的直布羅陀基地，隨後炸掉了玄武要塞的能源核心。然而美國總統的反蘇聯情緒使雙方關係出現裂痕，迫於無奈盟軍決定刺殺總統。隨後盟軍和蘇聯約定進攻東京癱瘓東京的指揮部和軍隊系統，但是蘇聯軍隊沒有如約參戰，戰後日本投降。隨後逃往德國的蘇聯科學家澤沃斯基爆料蘇聯在哈瓦那秘密發展軍隊，盟軍前去偵查果然發現了大量的軍隊。在粉碎了哈瓦那的陰謀後盟軍決定對蘇聯發動最後一戰，這時候查丹科和庫可夫準備逃往太空，摧毀了被改造成太空船的列寧格勒堡壘後蘇聯領導被打入冰牢。蘇聯戰役：日本的突襲使蘇聯措手不及，雖然盟軍被擊退但是日本已經深入內地並透過水路襲擊了列寧格勒，失敗後轉投莫斯科，蘇聯動用了K-45衛星挫敗了日本的行動。隨後收回了位於海參崴的海軍軍港。這時美國新總統阿克曼對蘇聯宣戰，蘇聯決定摧毀日內瓦的盟軍總部，隨後佔領了米諾克斯的研究設施，摧毀了歐盟最後的空軍基地剷除了庫可夫將軍（目測是查丹科陷害的）。隨後進攻日本本土，在東京擊敗日本三位指揮官後殺死了天皇。盟軍忌憚蘇聯的實力準備講和，蘇聯設了一個圈套但是被識破，在擊敗盟軍（歐盟方面）主力後查丹科露出真面目準備剷除指揮官，但是被指揮官擊斃。隨後蘇聯進攻紐約，摧毀了美國的主力和自由的象徵：自由女神像，盟軍投降。日本：戰鬥初期，天皇透過摧毀蘇聯的紀念碑雕像來摧毀蘇聯戰士的意志，突襲了沃爾庫塔並摧毀了當地的無畏戰艦戰鬥群，隨後進軍斯大林格勒並佔領運河，在敖德薩組裝了強大的戰爭機器將軍劊子手，夷平了敖德薩。但是天皇的唯心主義嚴重忽略了盟軍的實力，盟軍進攻了珍珠港（遊戲裡是日本軍港），在粉碎進攻後天皇發現盟軍分兵進攻了日本本土——僅僅由玄武要塞守護的東京，摧毀所有盟軍MVC後盟軍利用超時空技術進攻了要塞並開始破壞要塞核心，日本利用天翼飛艇搶回了要塞並依靠要塞的強大設施粉碎了盟軍海軍。隨後天皇繼續文宣攻勢利用浮島要塞進攻了盟軍的聖摩尼卡佔領了那裡的廣播臺。盟軍和蘇聯意識到了帝國的強大決定聯手，澤沃斯基和總統的對話被監聽，天皇得知日本是時間錯誤的產物喪失了對神的天命的信仰，同時交班給太子達郎，此時蘇萌聯軍進攻橫濱並在對岸架設了針對日本奈米科技的通訊隔離設施，在帝國強大的Yuriko Omega的幫助下日本成功擊退了聯軍摧毀了隔離設施。達郎決定徹底摧毀蘇聯，於是進攻莫斯科，同時調動了將軍劊子手，依靠將軍劊子手，日本摧毀了莫斯科和克里姆林宮，蘇聯領導希望轉移時間機器的資料再次使用，但是載著資料的直升機也被擊落了，蘇聯戰敗。隨後日本進攻了位於阿姆斯特丹的盟軍空軍基地和未來科技公司總部，由於盟軍強大的空軍火力，日本的空軍無法使用，在摧毀了空軍基地、癱瘓了質子撞擊炮以後，流亡的蘇聯科學家澤沃斯基攜帶強大的軍隊進入戰場並和未來科技公司達成協議研究超時空傳送儀準備改變戰局。擊敗蘇聯和盟軍的聯軍後，澤沃斯基利用超時空傳送儀送出了數顆毀滅武器夷平阿姆斯特丹，天皇緊急調入自己的直屬精英部隊（全部星級）進入戰場對抗守衛未來科技公司的軍隊，成功摧毀了未來科技公司總部，毀滅了超時空傳送儀的資料，日本完成了稱霸世界的任務。