轉座子可以分為兩大類:以DNA-DNA方式轉座的轉座子和反轉錄轉座子(retrotransposon)。第一類轉座子又稱為返座元(retroposon)〔3〕,是近年新發現的由RNA介導轉座的轉座元件,在結構和複製上與反轉錄病毒(retrovirus)類似,只是沒有病毒感染必須的env基因,它透過轉錄合成mRNA,再逆轉錄合成新的元件整合到基因組中完成轉座,每轉座1次複製數就會增加1份,因此它是目前所知高等植物中數量最大的一類可活動遺傳成分。目前共發現了3種類型反轉錄轉座子:Tyl-copia類,Ty3-gypsy類和LINE(long interspersed nuclear elements)類轉座子,前兩類是具有長末端重複的轉座子,LINE類轉座子沒有長末端重複。高等植物中的反轉錄轉座子主要屬於Tyl-copia類,分佈十分廣泛,幾乎覆蓋了所有高等植物種類〔4〕。第二類轉座子可以透過DNA複製或直接切除兩種方式獲得可移片段,重新插入基因組DNA中。根據轉座的自主性,這類元件又可以分為自主轉座元件和非自主轉座元件,前者則需在自主元件存在時方可轉座,後者本身能夠編碼轉座酶而進行轉座,以玉米的Ac/Ds體系為例,Ac(Activator)屬於自主元件,Ds(Dissociation)則是非自主元件,必需在Ac元件存在下才能轉座〔1〕。
克隆轉座子主要有兩條途徑:其一,利用抗體識別或cDNA探針從野生型植株中獲得表達量降低或不穩定基因座的序列,再從突變體中分離得到相應的轉座子:其二是根據序列同源性,在基因組的不同位置分離同一家族的轉座子成員。目前已經克隆的植物轉座子約156種(來自Genbank的報告),表1列出了常用於轉座子標籤的一些植物轉座子。
表1 常用植物轉座子標籤的轉座子
名 稱 來 源 類 型
Ac(Activator) 玉米 Ⅰ類自主型轉座子
Ds(Dissociation) 玉米 Ⅰ類非自主型轉座子
Mu(Mutator) 玉米 Ⅰ類自主型轉座子
Spm/En 玉米 Ⅰ類自主型轉座子
Tam 金魚草 Ⅰ類自主型轉座子
dTphl 擬南芥 Ⅰ類自主型轉座子
Tos17 水稻反轉錄轉座子
轉座子可以分為兩大類:以DNA-DNA方式轉座的轉座子和反轉錄轉座子(retrotransposon)。第一類轉座子又稱為返座元(retroposon)〔3〕,是近年新發現的由RNA介導轉座的轉座元件,在結構和複製上與反轉錄病毒(retrovirus)類似,只是沒有病毒感染必須的env基因,它透過轉錄合成mRNA,再逆轉錄合成新的元件整合到基因組中完成轉座,每轉座1次複製數就會增加1份,因此它是目前所知高等植物中數量最大的一類可活動遺傳成分。目前共發現了3種類型反轉錄轉座子:Tyl-copia類,Ty3-gypsy類和LINE(long interspersed nuclear elements)類轉座子,前兩類是具有長末端重複的轉座子,LINE類轉座子沒有長末端重複。高等植物中的反轉錄轉座子主要屬於Tyl-copia類,分佈十分廣泛,幾乎覆蓋了所有高等植物種類〔4〕。第二類轉座子可以透過DNA複製或直接切除兩種方式獲得可移片段,重新插入基因組DNA中。根據轉座的自主性,這類元件又可以分為自主轉座元件和非自主轉座元件,前者則需在自主元件存在時方可轉座,後者本身能夠編碼轉座酶而進行轉座,以玉米的Ac/Ds體系為例,Ac(Activator)屬於自主元件,Ds(Dissociation)則是非自主元件,必需在Ac元件存在下才能轉座〔1〕。
克隆轉座子主要有兩條途徑:其一,利用抗體識別或cDNA探針從野生型植株中獲得表達量降低或不穩定基因座的序列,再從突變體中分離得到相應的轉座子:其二是根據序列同源性,在基因組的不同位置分離同一家族的轉座子成員。目前已經克隆的植物轉座子約156種(來自Genbank的報告),表1列出了常用於轉座子標籤的一些植物轉座子。
表1 常用植物轉座子標籤的轉座子
名 稱 來 源 類 型
Ac(Activator) 玉米 Ⅰ類自主型轉座子
Ds(Dissociation) 玉米 Ⅰ類非自主型轉座子
Mu(Mutator) 玉米 Ⅰ類自主型轉座子
Spm/En 玉米 Ⅰ類自主型轉座子
Tam 金魚草 Ⅰ類自主型轉座子
dTphl 擬南芥 Ⅰ類自主型轉座子
Tos17 水稻反轉錄轉座子