人類消化道分為上消化和下消化，上消化又口腔、咽、食管、胃、十二指腸組成。下消化由空腸、迴腸和大腸組成。人類中棲息著100萬億以上的微生物，種類多達400種，人體消化道具體有多少微生物數量無法估計，大約有100萬億個，比如口腔，牙菌斑中，菌計數為2*10^11個/克溼重菌斑，腸中，每平方釐米的地方聚居著達100億個微生物；

健康的人體大約是100萬億個細菌的家園。它們位於面板表面，口腔內，鼻腔內和泌尿道內，但大多數生活在大腸內。每個人的腸道里每時每刻都生活著一到兩斤的細菌。至少有5600個不同的物種或菌株。

你的腸道是你身體的熱帶雨林，至少在細菌多樣性方面是這樣。有人估計，每個人的腸道里每時每刻都生活著一到兩斤的細菌。

就數量而言，哺乳動物結腸是地球上發現的最密集的微生物群落之一。健康的人體大約是100萬億個細菌的家園。它們位於面板表面，口腔內，鼻腔內和泌尿道內，但大多數生活在大腸內。

此前對人類結腸中不同種類微生物數量的估計高達500種。這些較早的估計是透過在皮氏培養皿中培養生活在較低腸道的細菌得出的，但這種方法往往將較稀有的物種排除在外，只捕獲它們更常見的同類。

使用焦磷酸測序技術，可以得到了一種更完整的計數方法，這種方法可以計算出不同種類的細菌在人類結腸中的數量。

焦磷酸測序以前曾用於評估海洋環境和土壤中細菌生態系統的豐富程度。但我們也可以利用它來研究我們身體內部的生態系統，從而有助於幫助我們瞭解自己的身體。

焦磷酸測序從被檢測生物的基因中複製出大量的小型DNA“標籤”。透過觀察編碼所有活細胞中普遍存在的分子的DNA序列的變化，可以將物種彼此區分開來。這項基因測序技術讓我們檢查到的‘細菌身份證’比以前的檢測方法多得多

這項研究發現，結腸中的細菌群落比以前想象的更加多樣化，至少發現了5600個不同的物種或菌株。

而腸道微生物總的來說,它們管好自己的事,我們進食到胃裡的食物餵養它們,它們還執行關鍵功能,如微調我們的免疫系統和生產營養成分如維生素k，還透過佔據“腸房地產”和吃了我們的多餘食物,他們阻止病原體獲得一個立足點。

服用抗生素可以減少駐留菌群的數量和多樣性。許多科學家擔心過度使用抗生素會造成大規模的影響，尤其是可能產生更多對抗生素有抗藥性的有害細菌。

焦磷酸測序將有助於更好地弄清抗生素對有益菌及其人類宿主的影響。