為明確診斷，指導治療或判斷預後，而又無穿刺禁忌證時，內科各種原發、繼發及遺傳性腎實質疾病（尤其是瀰漫性病變）皆可腎穿刺。⑴原發性腎臟疾病：①急性腎炎綜合徵，腎功能急劇壞轉、疑急進性腎炎時，應儘早穿刺；按急性腎炎治療2～3月病情無好轉應做腎穿。②原發性腎病綜合徵，先治療，激素規則治療8周無效時腎穿刺；或先穿刺，根據病理型別有區別的治療。③無症狀性血尿，變形紅細胞血尿臨床診斷不清時，無症狀性蛋白尿，蛋白尿持續>1g/d診斷不清時應做腎穿刺檢查。⑵繼發性或遺傳性腎臟病：臨床懷疑無法確診時，臨床已確診，但腎臟病理資料對指導治療或判斷預後有重要意義時應做腎穿刺。⑶急性腎功能衰竭：臨床及實驗室檢查無法確定其病因時應及時穿刺（包括慢性腎臟病人腎功能急劇壞轉）。⑷移植腎：①腎功能明顯減退原因不清時，②嚴重排異反應決定是否切除移植腎；③懷疑原有腎臟病在移植腎中復發。腎穿刺是一種創傷性檢查，選擇穿刺病例時不但需掌握好適應徵，還要認真排除禁忌徵。⑴絕對禁忌證：①明顯出血傾向，②重度高血壓，③精神病或不配合操作者，④孤立腎，⑤小腎。⑵相對禁忌證：①活動性腎盂腎炎、腎結核、腎盂積水或積膿，腎膿腫或腎周圍膿腫。②腎腫瘤或腎動脈瘤。③多囊腎或腎臟大囊腫。④腎臟位置過高（深吸氣腎下極也不達十二肋下）或遊走腎。⑤慢性腎功能衰竭。⑥過度肥胖。⑦重度腹水。⑧心功能衰竭、嚴重貧血、低血容量、妊娠或年邁者。