康熙很矛盾，還是選擇了鞏固世俗政權。功成十字血成溪，百丈恩流分自西。身裂四衙半夜路，徒方三背兩番雞。五千鞭撻寸膚裂，六尺懸垂二盜齊。慘慟八垓警九品，七言一畢萬靈啼。 ——康熙

在康熙在位的前期，天主教在中國有了很大的發展。康熙對天主教採取開明的態度不僅是由於他自身對西方文化的親和與想利用西方傳教士的科學知識為清王朝服務，更重要的是耶穌會一直遵循利瑪竇的傳教路線，一定上掩蓋了中西方文化的本質差異。在康熙看來“自利瑪竇到中國二百餘年,並無貪淫邪說,無非修道,平安無事,未犯中國法度。”因此，只要西方傳教士遵守中國“法度”，他可以允許他們在中國傳教。一旦天主教會改變原先的傳教方式，對中國的傳統文化造成衝擊，甚至想要挑戰他的皇權的時候，他是不會允許的。

1707年，多羅在南京宣佈羅馬教廷已經決定禁止祭祖祭孔的禮儀，要求在華傳教士一體遵行。康熙早已經對禮儀之爭十分的不耐煩，對多羅也沒有好感，多羅此舉激怒了康熙,他於是把多羅驅逐到澳門,交由葡萄牙澳門總督看管。康熙還下令凡願繼續在華的傳教士必須表明遵守中國禮儀,領取政府頒佈的傳教印票,“票上寫西洋某華人,年若干,在某會,來中國若干年,永不回覆西洋。多明我會士、巴黎外方傳教會和羅馬傳信部的神父拒絕“具結”,被康熙驅逐出境。

1721年1月17日，康熙閱覽了嘉樂教宗禁約的譯本，瞭解到羅馬教廷和10年前的態度沒有任何變化,勃然大怒,在教皇禁令上硃批:“覽此告示,只可說是西洋人等小人,如何言得中國之大理。況西洋人等,無一人通漢書者。說言議論,令人可笑者多。今見來臣告示,竟是和尚道士,異端小教相同。彼此亂言者莫可如何。以後不必西洋人在中國傳教,禁止可也,免得多事。”康熙這時有了禁止天主教的意思已經十分明顯。