在種蛋孵化過程中，相對溼度是種蛋孵化過程中僅次於溫度的重要條件。在鴨蛋孵化過程中，蛋內水分不斷向外蒸發，但水的蒸發需保持一定的速度，胚胎才能正常地生長髮育，水分蒸發過快或過慢都會影響胚胎髮育，降低孵化率和雛鴨質量。相對溼度過低，種蛋內水分蒸發量增加，加上蛋黃脂肪含量高，含水量低，代謝熱高，蛋內水分容易蒸發，易引發胚胎與殼膜粘連，造成出殼困難，孵化率降低，並且出殼雛鴨體重小，雛鴨的喙和趾蹼乾燥；相對溼度過高，不利於蛋內水分正常蒸發，導致胚胎髮育緩慢，雛鴨出殼延期，出雛率降低，且雛鴨“水腫肚”較多，精神萎靡，死亡率增加。溼度變化總的原則是“兩頭高，中間低”。孵化初期，相對溼度控制在65%～70%；孵化中期，相對溼度控制在60%為宜；孵化後期，相對溼度控制在70%～75%為宜。在鴨蛋孵化後期如果溼度不夠，可直接在蛋殼表面噴灑溫水，以增加溼度。巷道式孵化機的加溼系統，主要是氣體霧化加溼，兩側霧化均勻對稱與否是兩側偏溫的決定因素。氣壓太高，加溼電磁閥易損壞，或因漏氣而加溼失控；氣壓太低，霧化不好，使機內溼度太低，長時間連續加溼，易燒壞電磁閥線圈。一般氣壓以0.65～0.8兆帕為宜，加溼效果最好。目前，中國多數生產廠家在孵化機內裝有乾溼球溫度計或相對溼度計，能準確測定孵化機內的相對溼度。