1、直接宰殺法。將鱷魚龜入盤中，用刷子把鱷魚龜全身泥土刷乾淨，滴乾水。

用筷子逗龜咬住後，將龜頭拉出，用刀砍斷頭頸，將龜頸向下，讓龜血流入預先準備好的米碗中(100～150克米)，讓龜血與米拌勻，再與洗乾淨的內臟一同煮粥，味道鮮美，補血養顏。尤其對小兒疳積、遺尿有奇效。

然後將整個龜放入70～80℃的熱水中(剛燒起水泡)燙一下拿出來，將龜外殼及頭部四肢的皮脫去。注意水溫過高不能將外皮衣脫去，會造成泥腥味重及口感差。

水脫衣後，將龜反轉腹甲向上，用刀向腹甲兩邊四肢腋下連線處的甲橋砍去，或用短木或錘子敲擊刀背進刀。砍開甲橋後，用鋒利小刀順著龜皮與甲殼連線處切開，然後用刀將龜頸骨、龜尾骨與背殼連線處砍斷，即可以將背甲與龜肉分離，將內臟取出整理洗淨，肉砍成塊待用。

2、燙死宰殺法。有人怕被鱷魚龜咬，就把龜放入鐵鍋內放水蓋好燒火，溫度逐漸升高，龜受熱後將糞便排出很快死去，待水70～80℃時將龜撈出脫皮，用上述方法操刀將殼肉分離，並洗淨腹中濁血水，斬件待用。用熱水燙死法，使龜的血液凝結在肌體內，可增加肉味的鮮美和營養價值。

鱷魚龜肉無論煲湯或做其他菜餚，一般都將龜肉放到沸水中焯透撈出備用。煲湯時先將甲殼及骨頭放入鍋內文火煲幾小時，待龜板膠析出後，再放入龜肉及其他配料再煲2小時左右即可上桌食用。