甲胎蛋白（AFP）是一種糖蛋白，正常情況下，這種蛋白主要來自胚胎的肝細胞，正常人血清中AFP的含量極低。

AFP是診斷原發性肝癌的特異性腫瘤標誌物，具有確立診斷、早期診斷、鑑別診斷的作用。

甲胎蛋白由新生的幼稚肝細胞分泌，胎兒的肝細胞沒有發育（分化）完全，分泌的甲胎蛋白量很大，所以孕婦的甲胎蛋白會陽性。

肝癌細胞是尚未分化的肝細胞能大量分泌甲胎蛋白。

檢測甲胎蛋白的方法有好幾種，放射免疫法測得的甲胎蛋白大於500微克/升、且持續4周，或甲胎蛋白在200～500微克/升、持續8周，在排除其它引起甲胎蛋白增高的因素如急、慢性肝炎、肝炎後肝硬化、胚胎瘤、消化道癌症後，再結合定位檢查，如B超、CT、磁共振（MRI）和肝血管造影等即可診斷原發性肝癌。

正常懷孕的婦女、少數肝炎和肝硬化、生殖腺惡性腫瘤等情況下甲胎蛋白也會升高，但升高的幅度不如肝癌那樣高。

所以AFP升高，並且幅度特別大的時候需要進一步檢查，排查肝臟問題。

肝癌甲胎蛋白高165和1000以上，那就是說已經明確診斷了是肝癌（原發性肝癌），甲胎蛋白高165和1000以上會有什麼區別？當然有區別，數字上就有區別，但我想這不是你想要的答案。不過你的問題沒有說清楚，問這個問題的目的是什麼，你想了解的不同，是指兩個肝癌病人，一個甲胎蛋白165，一個1000以上，兩個病人有什麼不同嗎？還是是同一個肝癌病人，之前是165，現在是1000以上，或者之前是1000以上，現在是165，想了解這有什麼不同。

先來說前一種情況，兩個肝癌病人，一個甲胎蛋白165，一個1000以上，兩個病人有什麼不同嗎？這個其實除了甲胎蛋白數字上一個高一個低，單從這個數字上想了解兩個病人的病情是很難的，甲胎蛋白1000以上的未必就比甲胎蛋白165的嚴重，有的晚期肝癌甲胎蛋白都可以是正常的，而有的早期肝癌甲胎蛋白可能很高，所以不能根據抽血查甲胎蛋白來比較兩個病人。

再來說後一種情況，是同一個肝癌病人先後兩次甲胎蛋白水平不同。如果之前是165，現在是1000以上，那提示可能病情在惡化，在進展，當然要確實是不是真的病情在進展，需要影像檢查來證實，提血查甲胎蛋白只是提示有這個可能。如果之前是1000以上，現在是165，提示可能治療有效（通常只有在治療的情況下，甲胎蛋白才會明顯下降，除非這個甲胎蛋白升高不是肝癌引起的而是其他原因），病情有所好轉，但同樣要透過影像檢查來證實。