細菌、真菌和病毒的區別在於它們的結構病毒：無完整細胞結構，含單一核酸（DNA或RNA）型，病毒寄生在活細胞中，掠奪別人的營養生存，危害大，如愛滋病毒，生存在人體免疫細胞，破壞人體自身保護。細菌：是屬於原核型細胞的一種單胞生物，形體微小，結構簡單，無成形細胞核、也無核仁和核膜，除核蛋白體外無其他細胞器； 細菌廣泛分佈於土壤和水中，或者與其他生物共生。人體身上也帶有相當多的細菌。據估計，人體內及表皮上的細菌細胞總數約是人體細胞總數的十倍；細菌的營養方式有自營及異營，其中異營的腐生細菌是生態系中重要的分解者，使碳迴圈能順利進行。部分細菌會進行固氮作用，使氮元素得以轉換為生物能利用的形式。真菌：是具有真核和細胞壁的生物； 真菌像細菌和微生物一樣都是分解者，就是一些分解死亡生物的有機物的生物。真菌將生物分解為各類無機物，使土地肥力增強。還有的真菌用於食物加工，例如酵母菌用於麵包等加工，釀酒也需要真菌。 在農業、林業和畜牧業中，真菌又有有害的一面。真菌能引起植物多種病害，從而造成巨大的經濟損失。目前所知最厲害的病毒應該是叫埃博拉病毒，但其實對人類威脅最大的還是細菌，因為病毒結構單一，再厲害的病毒在數十代複製之後都會產生變異，有的病毒一旦變異了就沒有那麼大的威脅了，而細菌呢時時刻刻影響著人類，所以青黴素的發明拯救了數以億計的生命。所以給這三者危害排名：細菌>病毒>真菌。但是如果說是致死率：病毒>細菌>真菌。