在戰亂的一段時間過後，宇智波一族生活在了木葉村。但由於他們的成員並不允許干涉國家大事，也很少與外界交流，就慢慢被人們所淡化和遺忘。其中就有人不甘現在的生活，想要恢復家族的名聲和地位，有了叛變的企圖。其中就以鼬的父母為首。但當時鼬已經成為木葉的暗部成員之一，同時也瞭解到了家族人計劃發動戰爭的事情，木葉高層要求他不惜一切代價去阻止這場叛亂，言外之意即是命令他殺死全族人。鼬無法拒絕這個要求，因為他不想讓更多人受到戰爭的傷害。可以想像，當時鼬的心情。因為他要執行的任務是殺掉和自己生活了十多年的同族人，還有自己深愛的親人，甚至有自己摯愛的弟弟佐助。

　　因為鼬從小就看到過因戰亂而造成的傷害，培養了他的那一顆熱愛和平的心，此時此刻他正面臨和平和摯親的選擇，最終他忍痛割愛，選擇了為和平殺死族人。

　　於是鼬夥同其他暗部，在一夜之間將全村人殺死，惟獨留下了他摯愛的弟弟，並故意讓弟弟看見族人和父母倒在血泊中，但又因無法向年幼的佐助說明實情，就故意騙他說是自己為了測量容器殺死族人，原因是，他想讓佐助仇恨自己，報著殺死自己的決心，在今後的殘酷的戰爭中生存下來，而鼬自己卻願意揹負一切惡名，成為木葉的叛逃忍者。

　　距今為止用過四次月讀（已知的）卡卡西一次，佐助三次（佐助小時候的回憶，在自己看到親人都被殺死後在房間裡中了鼬的月讀；在鼬找到鳴人的時候在旅館對佐助又用了一次；兄弟大戰時最後用了一次）。

　　鼬死亡前，曾對佐助說了一些密語。在後面佐助與斑的談話中，揭示了是：“原諒我佐助，這是最後一次了。”

　　他最後的戳額頭一方面是為了將瞳術注入佐助的體內，另一方面也是因為對佐助深深的愛，並藉此保護佐助。不被斑所害。