主要是三個原因：繼承人制度不健全，種族歧視，未形成有效的統治制度。

由於蒙古帝國起源於草原，他們崇尚與武力，假如幾個人都是有血統的合法性，誰的拳頭硬誰就能作為繼承人繼承統治地位。這一套在草原上還是比較有效的，因為社會結構簡單，所統治的疆域有限，即使發動戰爭也是小規模的戰爭，不會對社會產生重大影響。但是到了後期蒙古已經成為一個超級大國的時候，由於繼承人制度不健全，大家都認為自己可以當皇帝，於是發動戰爭，政變，宮變這些都會嚴重影響社會的穩定，導致各種社會問題的產生，比如政治制度的朝令夕改。

這個大家都知道

比如禁止漢人打獵、學習拳擊武術、持有兵器、集會拜神、趕集趕場作買賣、夜間走路。“殺蒙古人的償命，殺色目人的罰黃金四十巴里失，而殺死一個漢人，只要繳一頭毛驢的價錢。漢人如當兵則不許充宿衛。

蒙古帝國是個很奇怪的，作為統治者，他們從來沒有形成有效的統治制度，他們總覺得自己只是一個倉庫管理員，中原就是一個大倉庫，只有拿到自己北方的草原才是自家的。這就導致一個問題，在元朝內部統治者的想法就是隻要你不造反，把錢給足，其他的就是你們 的自由，當官就想各種辦法搜刮，各種名目的賦稅壓在廣大老百姓的身上，當然這也是為什麼元朝思想，宗教自由的原因。老百姓沒有飯吃，要其他自由沒有用，於是只能造反，其實在元朝末年，元朝的軍隊還是很厲害的，但是由於繼承製度的不健全，上層統治者不斷的相互爭鬥，導致系列的戰略軍事指揮失誤，最終被趕回了草原。

大元自1271年建立至1368年滅亡，僅僅存活了短短的98年。為什麼曾經強大的蒙帝國，這麼快就滅亡了呢？

一個主要的原因就是，蒙古的這些貴族們一直沒有融入到漢文化之中。他們大都信奉基督教和伊斯蘭教，有幾個皇帝還是基督教徒。他們都排斥漢文化，也排斥農耕文明，整天盤算著把這些城市都推平，住在蒙古包裡，然後全部種上牧草用來放牧。除了忽必烈還懂一些漢語外，後面的皇帝們大都聽不懂中國話，漢字也不認識，整個一群外華人。你不瞭解全國的漢人在想什麼，你怎麼統治他們？畢竟漢人佔全部人口的大多數。這些貴族們也不拿漢人當自己的子民，他們認為這些漢人與牲畜的不同，就是兩條腿和肆條腿走路的區別，他們規定蒙古人打死漢人只需要賠償一頭毛驢的價錢。漢人連名字都不允許有，只能用數字表示，比如，朱元璋因為生日是八月初八，名字就叫朱重八，也就是朱八八，他的父親叫朱五四，爺爺叫朱初一。

再一個問題就是蒙古人入主中原後，就迅速的腐化了，窮奢極欲，只知道吃喝玩樂。軍備廢弛，有的將軍們馬都不會騎了，也拉不開重弓，當年跟隨成吉思汗馳騁歐亞大陸的威猛蕩然無存。他們還內鬥嚴重，忽必烈死後四十年裡換了十位皇帝，權臣把持朝政，只管大肆斂財，不顧百姓死活，造成民族矛盾尖銳。

俗話說的好“官逼民反”，元朝末年，全國各地爆發了大規模的農民起義，最後有朱元璋推翻了元朝，建立大明。

口氣不小！元朝等於蒙古帝國嗎？趕回的只是元朝(其實真正地說只是把元朝從元朝全境擠回到北部而已)而不是蒙古帝國！

皇太極能夠成功即位，就是因為，遊牧民族都比較實在，有合法血統的時候，就是看看誰的拳頭大，誰比較能打誰比較能搶，任人唯親在草原上不可能，元朝也是這樣，但是元朝的統治疆域已經不僅僅在草原之上，但是他們卻不懂得入鄉隨俗，十分排斥漢文化，除了開國皇帝，忽必烈多多少少懂一些漢語以外，後面的皇帝都不懂，漢人那麼多，你卻連他們說什麼都不懂，怎麼統治，還有就是等級分化，元朝可以憑藉武力，統一全國，但是你這樣的等級分化會使下面的漢人十分怨恨，等於說就是一桶火藥，一但是溫度達到一個點（社會矛盾達到高潮） 只要有一點火星（農民起義）就會炸，對於漢人那一套，他們也不屑於學習，總是想著說怎麼把這些地方都變成牧場？然後來放牧，熟不知農耕文明已經在中國幾千年下來了，入主中原的少數民族，基本上都要實行漢化，不然很難統治，可是他們偏不偏要逆天而行，違背這個歷史定律，還有就是元朝末年，天災頻繁，導致了農民起義爆發，都是其實底層老百姓是很老實的，只要有一口飯吃，基本上不會想到造反，他們造反也是因為當地官的不厚道，因為不給他們活路的是當地官，沒有想徹徹底底推翻大元統治，但是元朝統治者也不管，他們就知道下面彙報上來是刁民在起事造反，暴力鎮壓，不分青紅皂白，一通亂打，蒙古鐵騎還是有相當戰鬥力的，農民起義很快就被鎮壓下去了，但是地方官不樂意呀，鎮壓這農民起義，我可以領賞，我可以立功，可是起義軍就這麼一點，那怎麼辦？就把起義軍的那個起義口號念一遍，凡是臉上有異樣的，就是起義軍，殺了，甚至到後面就是不分青紅皂白，看到人就殺，就說他是起義軍，然後拿去領賞，元朝統治者後面反應過來，可能是地方官的不對，但是人家地方官牆頭草風吹兩邊倒反過來說，哎，你看，是朝廷的錯，是他不給你們活路的，不是我的關係呀，這樣吧，我加入你們一起造反，還有就是因為元朝的疆域太大了，使得他們不用對外開放，因為他們統治的地方，各色各樣都有，就在他們的領土之內，不需要交流，直接就會了，所以他們就認為這是天朝上國，我們不需要對外開放，我們非常富有，於是就一天天的醉生夢死，貪圖享樂，不理朝政，下面的貪官汙吏一看，高層統治者都已經糜爛至此，那我們費什麼勁？一起享樂唄！最後，他們的樂從哪來？還不是剝削百姓來的嗎？1368年，大元滅亡