熒光顯微鏡和普通顯微鏡主要區別是照明光源不同。熒光顯微鏡使用的是紫外光照明，而普通顯微鏡使用的是可見光作為照明光源。熒光顯微鏡： 熒光顯微鏡是以紫外線為光源， 用以照射被檢物體， 使之發出熒光， 然後在顯微鏡下觀察物體的形狀及其所在位置。熒光顯微鏡用於研究細胞內物質的吸收、運輸、化學物質的分佈及定位等。 細胞中有些物質，如葉綠素等，受紫外線照射後可發熒光；另有一些物質本身雖不能發熒光，但如果用熒光染料或熒光抗體染色後，經紫外線照射亦可發熒光，熒光顯微鏡就是對這類物質進行定性和定量研究的工具之一。

主要區別

1熒光顯微鏡.照明方式通常為落射式，即光源透過物鏡投射於樣品上；

2.光源為紫外光，波長較短，分辨力高於普通顯微鏡；

3.有兩個特殊的濾光片，光源前的用以濾除可見光，目鏡和物鏡之間的用於濾除紫外線，用以保護人眼。

LW300LFT熒光顯微鏡也是光學顯微鏡的一種，主要的區別是二者的激發波長不同。由此決定了熒光顯微鏡與普通光學顯微鏡結構和使用方法上的不同。

熒光顯微鏡是免疫熒光細胞化學的基本工具。它是由光源、濾板系統和光學系統等主要部件組成。是利用一定波長的光激發標本發射熒光，透過物鏡和目鏡系統放大以觀察標本的熒光影象。