1、菸草炭疽病：
苗期主要病害。幼苗在“十字期”（2片真葉）最易感病。
病原：半知菌類，黑盤孢目，炭疽刺盤孢真菌。
侵染迴圈：以菌絲及分生孢子隨同病株殘體留在土壤和混在肥料中越冬，種子也帶菌。第二年溫度、溼度適宜，分生孢子萌發，形成吸器，從葉的正面、背面侵入。借風雨傳播。
流行規律：連綿多雨、大水漫灌、施未腐熟肥料、留苗過密、通風不良，發病重。
2、菸草猝倒病：
苗床常見病害。嚴重時可使煙苗成片死亡。
病原：鞭毛菌類，卵菌綱、霜黴目，多種黴腐菌，主要是瓜果腐黴菌。
侵染迴圈：為土壤習居菌，可在根部殘餘物上或有機質上腐生或寄生。以卵孢子或厚垣孢子越冬。條件適宜，產生芽管或遊動孢子。遊動孢子或菌絲從莖基部及根部侵入。靠地面流水傳播。
流行規律：低溫、高溼。降水多、煙苗過密、施未腐熟有機肥易大發生。
3、菸草黑脛病：
是菸草的重要病害之一。侵染根部和莖基部，下部葉片也可受侵染，引起煙株死亡。俗稱“穿大褂”、“腰爛”、“豬屎斑”或“黑膏藥”。
病原：鞭毛菌亞門，卵菌綱，霜黴目，腐黴科，疫黴屬。有4個不同生理小種。
侵染迴圈：以菌絲和厚壁孢子在土壤或混在糞肥中的病株殘體上越冬。靠流水和雨水飛濺傳播。以遊動孢子侵染表土或地面以下5釐米深的莖基部和根系。
流行規律：種植感病品種，連作田，7-8月分雨日多，雨量大，易大發生。
4、菸草赤星病：
主要為害葉片。造成病斑枯焦脫落。俗稱“紅斑”、“斑病”、“恨虎眼”、“火泡病”。
病原：為鏈格孢菌。屬闐知菌亞門，叢梗孢目，暗色孢科。
侵染迴圈：以菌絲在病株殘體上越冬。早春產生分生孢子傳播。分生孢子在葉面表面的水膜中，條件適宜，很快萌發，從葉毛基部細胞、葉片邊緣和蟲咬傷口處侵入。菌絲在葉片細胞間生長，破壞中膠層，使葉片組織乾枯。靠風雨傳播。
流行規律：成熟菸葉最易受侵染。如雨量大，雨日多，極易造成流行。
5、菸草蛙眼病：
主要發生在成熟和已收穫的菸葉。罹病菸葉缺乏彈性，極易破碎。
病原：菸草尾孢菌。屬半知菌亞門，暗色孢科。
發病條件：侵入衰弱及成熟葉片。一般腳葉先發病。土質粘重，陰雨連綿，種植過密，易發病。
6、菸草根黑腐病：
主要發生在根部，根呈黑色腐爛。幼苗、成株均有發生。
病原：根串珠黴菌，屬半知菌亞門，叢梗孢目，暗色孢菌科。是一種土壤習居菌。
侵染迴圈：黑腐病菌在土壤廣泛存在，寄主範圍廣，為害豆科、茄科等30多科，120多種植物。分生孢子和厚壁孢子萌發產生菌絲，皮層細胞被寄生後，在根部上、下表皮生長，進入根圍，破壞細胞組織，形成根腐。
發病條件：煙、豆科、茄科等連作田發病重。高溫、多雨、溼度大均易發生為害。
7、菸草低頭黑病：
地上部均可遭受侵害。形成半邊或全葉枯死，重病株則全株枯萎。
病原：為刺盤孢菌。屬半知菌亞門，黑盤地目，黑盤孢科。
侵染迴圈：以菌絲體和厚壁孢子，在病株殘體上越冬。病菌在土壤中可存活3年以上：。在適宜條件下病菌產生分生孢子盤和分生孢子，靠風雨傳播。
流行規律：重茬煙田，排水不良，土壤粘重，苗床管理不當，發病重。
8、菸草白粉病：
為害葉片。產量和質量下降，易破碎，缺彈性和香味。
病原：菊科白粉苗，屬子囊菌亞門，白粉菌目，白粉菌科。
侵染迴圈：以菌絲體和子囊殼在病殘株越冬。以子囊孢子、菌絲或分生孢子植株，借氣流傳播。
發病條件：溫暖、潮溼、日照少的年份或地區發病重。
9、菸草青枯病：
屬維管束病害。根、莖、葉各部都可受害，典型症狀是枯萎。
病原：青枯假單孢菌（茄假單孢）細菌。為害33科200多種植物。
侵染迴圈：病菌在土壤中及在土壤中的病株殘體上，或在種子或生長中的各種寄主體內越冬。從根部傷口侵入，自下部向上部發展。在寄主內繁殖，分泌果膠酶，溶解寄主細胞的中膠層，造成死亡、腐爛。
發病條件：高溫、高溼、土壤粘重、地下害蟲發生重、連作煙田，發病重。
10、菸草角斑病和野火病：
主要發生在成株後期。受害葉片易破碎，缺彈性，對產量和品質影響很大。
病原：均為短桿狀細菌。為害菸草、豆類、黃瓜、茄子、辣椒、白菜等數十種作物。
侵染迴圈：除在病株殘體上越冬外，還能在許多作物和雜草的根系附近存活，病菌藉助風雨、昆蟲傳播，以傷口侵入為主，也可從氣孔侵入。
發病條件：氮肥過多、鉀肥不足、夏天暴風雨發病重。
11、菸草空莖病：
一般於打頂末杈時發生。病菌從打頂傷口侵入，沿髓部向下蔓延，造成髓部腐爛，莖部變空。
病原：屬歐氏桿菌。侵染瓜、菜、馬鈴薯等120多種植物。
侵染迴圈：在土壤中及殘落在土壤中的葉片上存活越冬。從傷口侵入。
發病條件：與菸草、黃瓜、芹菜、馬鈴薯等作物重茬、高溫、多雨、土壤粘重、管理不良易發病。
12、菸草根結線蟲病：
又稱根瘤。苗期、大田均有發生。葉緣乾枯、內卷，生長不良。
病原：根結線蟲。侵染番茄、花生、柑桔等多種作物。
侵染迴圈：卵、幼蟲、成蟲在土壤中的菸草殘根或其它寄主殘根越冬。幼蟲從根部表皮侵入，形成根結。
流行條件：乾旱年份發病重，砂土發病重。
1、菸草炭疽病：
苗期主要病害。幼苗在“十字期”（2片真葉）最易感病。
病原：半知菌類，黑盤孢目，炭疽刺盤孢真菌。
侵染迴圈：以菌絲及分生孢子隨同病株殘體留在土壤和混在肥料中越冬，種子也帶菌。第二年溫度、溼度適宜，分生孢子萌發，形成吸器，從葉的正面、背面侵入。借風雨傳播。
流行規律：連綿多雨、大水漫灌、施未腐熟肥料、留苗過密、通風不良，發病重。
2、菸草猝倒病：
苗床常見病害。嚴重時可使煙苗成片死亡。
病原：鞭毛菌類，卵菌綱、霜黴目，多種黴腐菌，主要是瓜果腐黴菌。
侵染迴圈：為土壤習居菌，可在根部殘餘物上或有機質上腐生或寄生。以卵孢子或厚垣孢子越冬。條件適宜，產生芽管或遊動孢子。遊動孢子或菌絲從莖基部及根部侵入。靠地面流水傳播。
流行規律：低溫、高溼。降水多、煙苗過密、施未腐熟有機肥易大發生。
3、菸草黑脛病：
是菸草的重要病害之一。侵染根部和莖基部，下部葉片也可受侵染，引起煙株死亡。俗稱“穿大褂”、“腰爛”、“豬屎斑”或“黑膏藥”。
病原：鞭毛菌亞門，卵菌綱，霜黴目，腐黴科，疫黴屬。有4個不同生理小種。
侵染迴圈：以菌絲和厚壁孢子在土壤或混在糞肥中的病株殘體上越冬。靠流水和雨水飛濺傳播。以遊動孢子侵染表土或地面以下5釐米深的莖基部和根系。
流行規律：種植感病品種，連作田，7-8月分雨日多，雨量大，易大發生。
4、菸草赤星病：
主要為害葉片。造成病斑枯焦脫落。俗稱“紅斑”、“斑病”、“恨虎眼”、“火泡病”。
病原：為鏈格孢菌。屬闐知菌亞門，叢梗孢目，暗色孢科。
侵染迴圈：以菌絲在病株殘體上越冬。早春產生分生孢子傳播。分生孢子在葉面表面的水膜中，條件適宜，很快萌發，從葉毛基部細胞、葉片邊緣和蟲咬傷口處侵入。菌絲在葉片細胞間生長，破壞中膠層，使葉片組織乾枯。靠風雨傳播。
流行規律：成熟菸葉最易受侵染。如雨量大，雨日多，極易造成流行。
5、菸草蛙眼病：
主要發生在成熟和已收穫的菸葉。罹病菸葉缺乏彈性，極易破碎。
病原：菸草尾孢菌。屬半知菌亞門，暗色孢科。
發病條件：侵入衰弱及成熟葉片。一般腳葉先發病。土質粘重，陰雨連綿，種植過密，易發病。
6、菸草根黑腐病：
主要發生在根部，根呈黑色腐爛。幼苗、成株均有發生。
病原：根串珠黴菌，屬半知菌亞門，叢梗孢目，暗色孢菌科。是一種土壤習居菌。
侵染迴圈：黑腐病菌在土壤廣泛存在，寄主範圍廣，為害豆科、茄科等30多科，120多種植物。分生孢子和厚壁孢子萌發產生菌絲，皮層細胞被寄生後，在根部上、下表皮生長，進入根圍，破壞細胞組織，形成根腐。
發病條件：煙、豆科、茄科等連作田發病重。高溫、多雨、溼度大均易發生為害。
7、菸草低頭黑病：
地上部均可遭受侵害。形成半邊或全葉枯死，重病株則全株枯萎。
病原：為刺盤孢菌。屬半知菌亞門，黑盤地目，黑盤孢科。
侵染迴圈：以菌絲體和厚壁孢子，在病株殘體上越冬。病菌在土壤中可存活3年以上：。在適宜條件下病菌產生分生孢子盤和分生孢子，靠風雨傳播。
流行規律：重茬煙田，排水不良，土壤粘重，苗床管理不當，發病重。
8、菸草白粉病：
為害葉片。產量和質量下降，易破碎，缺彈性和香味。
病原：菊科白粉苗，屬子囊菌亞門，白粉菌目，白粉菌科。
侵染迴圈：以菌絲體和子囊殼在病殘株越冬。以子囊孢子、菌絲或分生孢子植株，借氣流傳播。
發病條件：溫暖、潮溼、日照少的年份或地區發病重。
9、菸草青枯病：
屬維管束病害。根、莖、葉各部都可受害，典型症狀是枯萎。
病原：青枯假單孢菌（茄假單孢）細菌。為害33科200多種植物。
侵染迴圈：病菌在土壤中及在土壤中的病株殘體上，或在種子或生長中的各種寄主體內越冬。從根部傷口侵入，自下部向上部發展。在寄主內繁殖，分泌果膠酶，溶解寄主細胞的中膠層，造成死亡、腐爛。
發病條件：高溫、高溼、土壤粘重、地下害蟲發生重、連作煙田，發病重。
10、菸草角斑病和野火病：
主要發生在成株後期。受害葉片易破碎，缺彈性，對產量和品質影響很大。
病原：均為短桿狀細菌。為害菸草、豆類、黃瓜、茄子、辣椒、白菜等數十種作物。
侵染迴圈：除在病株殘體上越冬外，還能在許多作物和雜草的根系附近存活，病菌藉助風雨、昆蟲傳播，以傷口侵入為主，也可從氣孔侵入。
發病條件：氮肥過多、鉀肥不足、夏天暴風雨發病重。
11、菸草空莖病：
一般於打頂末杈時發生。病菌從打頂傷口侵入，沿髓部向下蔓延，造成髓部腐爛，莖部變空。
病原：屬歐氏桿菌。侵染瓜、菜、馬鈴薯等120多種植物。
侵染迴圈：在土壤中及殘落在土壤中的葉片上存活越冬。從傷口侵入。
發病條件：與菸草、黃瓜、芹菜、馬鈴薯等作物重茬、高溫、多雨、土壤粘重、管理不良易發病。
12、菸草根結線蟲病：
又稱根瘤。苗期、大田均有發生。葉緣乾枯、內卷，生長不良。
病原：根結線蟲。侵染番茄、花生、柑桔等多種作物。
侵染迴圈：卵、幼蟲、成蟲在土壤中的菸草殘根或其它寄主殘根越冬。幼蟲從根部表皮侵入，形成根結。
流行條件：乾旱年份發病重，砂土發病重。