嘉靖元年（1522年，壬午） 正月，稱孝宗為皇考，慈壽皇太后為聖母。興獻王為興獻帝，母為興王后。 九月立陳氏為皇后。嘉靖二年（1523年，癸未） 四月，追尊興獻帝為本生皇考，母為本生聖母章聖皇太后。

嘉靖七年（1528年，戊子） 十月皇后陳氏卒。 十一月，立順妃張氏為皇后。

嘉靖九年（1530年，庚寅） 正月，定南北郊分祀，並另建日、月壇。 十月，詔選妃嬪。 十二月，初立九嬪。

嘉靖十年（1531年，辛卯） 十一月，在欽安殿行祈嗣大禮。 嘉靖十二年（1533年，癸巳） 三月，初開經筵。 五月，逮昌國公張鶴齡及其弟張延齡下獄。 十月，張延齡論死，張鶴齡革爵。

嘉靖十三年（1534年，甲午） 正月，廢皇后張氏，冊德妃方氏為皇后。嘉靖十四年（1535年，乙未） 十月，選補妃嬪，詔聖母命自選賢淑入宮。 嘉靖十五年（1536年，丙申） 十月，定獻皇帝廟為世廟。 十二月，廢后張氏卒。

嘉靖十六年（1537年，丁酉） 正月，皇三子朱載垕生。嘉靖十七年（1538年，戊戌） 九月，改太宗廟為成祖，獻皇帝廟號為睿宗。嘉靖十八年（1539年，己亥） 二月，立皇子載壑為皇太子，封載垕為裕王、載圳為景王。

嘉靖十九年（1540年，庚子） 五月，選淑女百人入宮。嘉靖二十年（1541年，辛丑） 八月，昭聖皇太后卒。嘉靖二十一年（1542年，壬寅） 四月，大高玄殿建成。 十月，壬寅宮變發生，宮女楊金英等十餘人謀弒未果，皆被凌遲。嘉靖皇帝移御西苑萬壽宮，不復回大內。

嘉靖二十三年（1544年，甲辰） 十月，俺答擾邊，京師戒嚴。嘉靖二十六年（1547年，丁未） 正月，選淑女三百人入宮。 十一月，方皇后卒。諡孝烈。

嘉靖二十七年（1548年，戊申） 正月，首輔嚴嵩專權之始。 四月，定嘉靖帝壽陵名永陵，葬孝烈方皇后。嘉靖二十八年（1549年，己酉） 三月，皇太子行冠禮，二日後卒。

嘉靖二十九年（1550年，庚戌） 六月，發生庚戌之變。 嘉靖三十三年（1554年，甲寅） 正月，康妃杜氏（穆宗生母）卒。嘉靖三十四年（1555年，乙卯） 九月，選淑女一百六十人入宮。

嘉靖三十六年（1557年，丁巳） 四月，奉天、華蓋、謹身三殿災。嘉靖四十年（1561年，辛酉）十一月，西苑萬壽宮災，帝移居玉熙宮。戚繼光陸續平定倭寇。

嘉靖四十一年（1562年，壬戌） 正月，重修萬壽宮成。 四月，帝遷回新宮。八月，裕王第三子翊鈞生。 十月，俺答擾掠京畿，京師戒嚴。

嘉靖四十三年（1564年，甲子） 正月，選淑女三百人入宮。 嘉靖四十四年（1565年，乙丑） 三月，嚴嵩削籍，籍沒，子世蕃以謀反罪誅。 十月，海瑞力諫帝，下詔獄。

嘉靖四十五年（1566年，丙寅） 十月，帝病重。 十二月，十四日，病危，回大內乾清宮，卒，年六十。遺詔裕王可即皇帝位。二十六日，裕王朱載垕即皇帝位。以明年為隆慶元年。