對於真核生物，脂質合成是在光面內質網上，因為脂質合成的酶類位於光面內質網；

對於原核生物，紙質合成是在細胞質基質中，因為脂質合成的酶類位於細胞質基質。

這與呼吸作用是類似的。真核生物線上粒體；原核生物在細胞質基質。也是因為呼吸酶的分佈不同。

生物合成：

1、脂肪酸

脂肪酸的生物合成biosynthesis of fattyacids 高階脂肪酸的合成，以乙醯CoA為基礎，透過乙醯輔酶A羧化酶的作用，在ATP的分解的同時與CO2結合，產生丙二酸單醯CoA，開始這一階段是控速步驟，為檸檬酸所促進。

丙二酸單醯CoA與乙醯CoA一起，在脂肪酸合成酶的催化下合成C16的軟脂酸（或C18的硬脂酸），但這是包括在醯基載體蛋白（ACP）參與下的脫羧、C2單位縮合、以及由NADPH還原過程在內的反覆進行的複雜過程。

產生的脂肪酸作為CoA衍生物，線上粒體中與乙醯CoA，在微粒體中與丙二酸單醯CoA縮合，每次增加兩個碳，不斷延長碳鏈。

而單不飽和脂肪酸，由飽和醯基CoA（或ACP）的好氧的不飽和化（微粒體，微生物等。必須有O2和NADH）而產生，或由脂肪酸生物合成途中的β-羥醯ACP的脫水反應（及碳鍵延長）而產生。

多聚不飽和脂肪酸在高等動物不一定產生，可以從攝取的不飽和酸的碳素鏈的延長等而轉變形成。另外環丙烷脂肪酸由S-腺苷甲硫氨酸的C1，結合於不飽和酸的雙鍵上而產生。脂肪酸作為CoA衍生物，用於合成各種底物。

2、其他脂類：磷脂的生成

磷脂酸是最簡單的磷脂，也是其他甘油磷脂的前體。磷脂酸與CTP反應生成CDP-二醯甘油，在分別與肌醇、絲氨酸、磷酸甘油反應，生成相應的磷脂。磷脂酸水解成二醯甘油，再與CDP-膽鹼或CDP-乙醇胺反應，分別生成磷脂醯膽鹼和磷脂醯乙醇胺。