在明確病因病機的基礎上，確定治療方法（或原則），根據治療方法組方。既是依法統方。組方時注意君臣佐使。方子的變化時時根據病機而變。

每一首方劑的組成自然要根據辨證及立法的需要，但是在藥物的配伍組成上還必須遵循一定的原則。關於中藥的配伍組方原則，早在《黃帝內經》中就有所論述。《素問至真要大論》說：“主病之為君，佐君之為臣，應臣之為使”。元代醫家李東垣說：“主病之為君，兼見何病，則以佐使藥分治之，此治方之要也”，“君藥分量最多，臣藥次之，佐使藥又次之，不可令臣過於君。君臣有序，相與宣攝，則可以御邪治病也”。明代醫家何柏齋說：“大抵藥之治病，各有所主。主治者，君也；輔治者，臣也；與君藥相反而相助者，佐也；引經及治病之藥至病所者，使也”。綜《內經》及歷代醫家所論，方劑組成原則的君、臣、佐、使概念大致如下：君藥：是針對主病或主證起主要治療作用的藥物，是方劑中不可缺少的主藥。臣藥：包含兩方面的意義。其一，為輔助君藥加強治療主病或主證的藥物；其二，是針對兼病或兼證起主要治療作用的藥物。佐藥：具有三方面意義。其一，即配合君、臣藥加強治療作用，或直接治療次要症狀；其二，用於減弱或消除君藥或臣藥的毒副作用，或可以制約君藥或臣藥的峻猛藥性；其三，是用於反佐的藥物，也就是說，當病重邪盛之時，人體可能出現“拒藥”現象，即服藥後立即發生嘔吐，這時適當配合與君藥性味相反的藥物可以減輕或消除“拒藥”現象，在這種情況下所用的與君藥性味相反的藥被稱為反佐藥。使藥：具有兩方面含義。其一，有引經藥之義，即發揮引導方中諸藥到達病所的作用；其二，具有調和方中諸藥的作用。以麻黃湯為例，該方出自張仲景的《傷寒論》，是治療外感風寒表實證的代表方劑。方中有麻黃6g，桂枝4g，杏仁9g，炙甘草3g。其中麻黃辛溫，有發汗解表散寒，宣肺平喘之效，為君藥；桂枝甘溫，解肌散寒，調和營衛，具有加強麻黃解表散寒功效的作用，為臣藥；杏仁苦溫，既可降肺氣以助麻黃平喘，又可散風寒以助麻黃、桂枝發汗，為佐藥；甘草甘溫，調和諸藥，為使藥。在臨床實際中，並不是每一個方劑都必須具備君、臣、佐、使，有時君藥和臣藥沒有毒性，藥性也不峻烈，可以不使用具有減低其毒性或減緩其藥性的佐藥。有時君藥本身就具有引經的作用，則無需使藥。有時一味藥組成一個單方，只有君藥，而無臣藥和佐使藥。有時十幾味甚至幾十味藥物組成一個方劑，君藥或臣藥可能有兩味或者更多味藥。總之，要了解中醫方劑學這一組方原則，在臨床中要結合實際情況在這一原則指導下靈活加以運用。